30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0466 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4100  MSHA biogenesis protein MshQ  49.25 
 
 		 1257 aa  654    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0521  hypothetical protein  49.31 
 
 		 1543 aa  638    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.402104 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0517  hypothetical protein  49.65 
 
 		 1543 aa  645    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0573  MSHA biogenesis protein MshQ  47.25 
 
 		 1258 aa  639    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0117136  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3473  MSHA biogenesis protein MshQ  49.59 
 
 		 1261 aa  656    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.928372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0478  MSHA biogenesis protein MshQ  48.76 
 
 		 1255 aa  647    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233703  normal  0.793103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3649  MSHA biogenesis protein MshQ  49.17 
 
 		 1248 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0466  MSHA biogenesis protein MshQ  100 
 
 		 837 aa  1719    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0264284  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3823  hypothetical protein  49.72 
 
 		 1541 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.473732  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0496  hypothetical protein  49.38 
 
 		 1543 aa  635  1e-180  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0848067  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3739  hypothetical protein  48.22 
 
 		 1532 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3335  hypothetical protein  47.38 
 
 		 1553 aa  610  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.545908  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4403  hypothetical protein  39.63 
 
 		 1463 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0402  MSHA biogenesis protein MshQ  34.11 
 
 		 900 aa  420  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0473177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0557  MSHA biogenesis protein MshQ  31 
 
 		 906 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0109211  normal  0.590942 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2833  hypothetical protein  40.93 
 
 		 1252 aa  291  3e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000270915  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3755  PA14 domain-containing protein  28.57 
 
 		 1382 aa  234  7.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111574  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0765  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1085 aa  222  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232029  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  31.5 
 
 		 1306 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  29.99 
 
 		 1072 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1504 aa  182  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3101  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1133 aa  166  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002382  hypothetical protein  26.47 
 
 		 1508 aa  145  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1576 aa  141  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00263  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshQ (pilus type IV)  25.31 
 
 		 1168 aa  141  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0182  CUB domain-containing protein  24.74 
 
 		 1537 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384689  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0888  hypothetical protein  30.45 
 
 		 1191 aa  100  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.199681 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03686  hypothetical protein  24.7 
 
 		 1544 aa  71.6  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001507  MSHA biogenesis protein MshQ  23.48 
 
 		 1008 aa  53.9  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101461  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  25.07 
 
 		 1202 aa  53.1  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>