31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0765 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0765  hypothetical protein  100 
 
 
1085 aa  2172    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232029  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0466  MSHA biogenesis protein MshQ  27.9 
 
 
837 aa  228  7e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0264284  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0573  MSHA biogenesis protein MshQ  28.81 
 
 
1258 aa  219  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0117136  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0402  MSHA biogenesis protein MshQ  28.25 
 
 
900 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0473177  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  30.03 
 
 
1306 aa  190  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0557  MSHA biogenesis protein MshQ  27.75 
 
 
906 aa  185  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0109211  normal  0.590942 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  28.57 
 
 
1072 aa  184  9.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4403  hypothetical protein  26.94 
 
 
1463 aa  180  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3473  MSHA biogenesis protein MshQ  30.6 
 
 
1261 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.928372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0478  MSHA biogenesis protein MshQ  30.16 
 
 
1255 aa  172  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233703  normal  0.793103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3649  MSHA biogenesis protein MshQ  29.93 
 
 
1248 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516469  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3755  PA14 domain-containing protein  27.21 
 
 
1382 aa  168  5.9999999999999996e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111574  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2833  hypothetical protein  26.29 
 
 
1252 aa  164  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000270915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  26.35 
 
 
1576 aa  153  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3823  hypothetical protein  28.45 
 
 
1541 aa  148  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.473732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0521  hypothetical protein  27.37 
 
 
1543 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.402104 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0517  hypothetical protein  27.43 
 
 
1543 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4100  MSHA biogenesis protein MshQ  29.12 
 
 
1257 aa  137  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0496  hypothetical protein  27.21 
 
 
1543 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0848067  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3335  hypothetical protein  26.98 
 
 
1553 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.545908  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0182  CUB domain-containing protein  26.11 
 
 
1537 aa  129  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3739  hypothetical protein  27.62 
 
 
1532 aa  125  5e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3101  hypothetical protein  26.84 
 
 
1133 aa  114  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002382  hypothetical protein  23.47 
 
 
1508 aa  107  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00263  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshQ (pilus type IV)  25.22 
 
 
1168 aa  98.2  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  26.43 
 
 
1202 aa  91.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  24.32 
 
 
1504 aa  88.6  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3471  hypothetical protein  36.84 
 
 
894 aa  53.9  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03686  hypothetical protein  29.17 
 
 
1544 aa  52.4  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05444  hypothetical protein  30.14 
 
 
793 aa  47.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001507  MSHA biogenesis protein MshQ  27.34 
 
 
1008 aa  45.1  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>