38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4403 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3335  hypothetical protein  44.22 
 
 		 1553 aa  1083    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.545908  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3823  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1541 aa  1024    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.473732  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3649  MSHA biogenesis protein MshQ  50.15 
 
 		 1248 aa  944    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3739  hypothetical protein  44.8 
 
 		 1532 aa  1073    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0478  MSHA biogenesis protein MshQ  50.7 
 
 		 1255 aa  947    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233703  normal  0.793103 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3473  MSHA biogenesis protein MshQ  50.3 
 
 		 1261 aa  924    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.928372 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0521  hypothetical protein  43.1 
 
 		 1543 aa  1034    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.402104 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0573  MSHA biogenesis protein MshQ  49.46 
 
 		 1258 aa  930    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0117136  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0496  hypothetical protein  42.96 
 
 		 1543 aa  1019    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0848067  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4403  hypothetical protein  100 
 
 		 1463 aa  2994    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0517  hypothetical protein  43.13 
 
 		 1543 aa  1036    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4100  MSHA biogenesis protein MshQ  42.02 
 
 		 1257 aa  727    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2833  hypothetical protein  36.52 
 
 		 1252 aa  551  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000270915  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0466  MSHA biogenesis protein MshQ  40.03 
 
 		 837 aa  482  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0264284  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0557  MSHA biogenesis protein MshQ  36.74 
 
 		 906 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0109211  normal  0.590942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0402  MSHA biogenesis protein MshQ  34.57 
 
 		 900 aa  386  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0473177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002382  hypothetical protein  30.93 
 
 		 1508 aa  338  3.9999999999999995e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3755  PA14 domain-containing protein  29.34 
 
 		 1382 aa  281  6e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111574  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  29.26 
 
 		 1072 aa  229  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  29.58 
 
 		 1306 aa  229  4e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0888  hypothetical protein  46.21 
 
 		 1191 aa  199  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.199681 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00263  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshQ (pilus type IV)  27.9 
 
 		 1168 aa  176  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  42.25 
 
 		 1202 aa  176  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0765  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1085 aa  172  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232029  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  26.38 
 
 		 1504 aa  173  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1576 aa  159  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3101  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1133 aa  137  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0182  CUB domain-containing protein  23.55 
 
 		 1537 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384689  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  34.15 
 
 		 2642 aa  120  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03686  hypothetical protein  25.05 
 
 		 1544 aa  99.8  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  32.46 
 
 		 900 aa  100  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  27.78 
 
 		 3911 aa  72.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  35.37 
 
 		 1111 aa  72  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  44.33 
 
 		 1127 aa  63.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  28.76 
 
 		 4896 aa  63.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  27.48 
 
 		 907 aa  62.8  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001507  MSHA biogenesis protein MshQ  22.68 
 
 		 1008 aa  58.5  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101461  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05444  hypothetical protein  23.03 
 
 		 793 aa  48.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>