37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3473 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3649  MSHA biogenesis protein MshQ  89.42 
 
 		 1248 aa  2320    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4403  hypothetical protein  50 
 
 		 1463 aa  912    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0517  hypothetical protein  53.53 
 
 		 1543 aa  991    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0496  hypothetical protein  53.33 
 
 		 1543 aa  982    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0848067  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0573  MSHA biogenesis protein MshQ  75.74 
 
 		 1258 aa  1719    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0117136  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3823  hypothetical protein  52.32 
 
 		 1541 aa  969    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.473732  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0466  MSHA biogenesis protein MshQ  49.59 
 
 		 837 aa  657    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0264284  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3739  hypothetical protein  51.62 
 
 		 1532 aa  931    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0478  MSHA biogenesis protein MshQ  87.08 
 
 		 1255 aa  1938    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233703  normal  0.793103 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3473  MSHA biogenesis protein MshQ  100 
 
 		 1261 aa  2584    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.928372 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3335  hypothetical protein  49.09 
 
 		 1553 aa  896    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.545908  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4100  MSHA biogenesis protein MshQ  59.74 
 
 		 1257 aa  1347    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0521  hypothetical protein  51.71 
 
 		 1543 aa  963    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.402104 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2833  hypothetical protein  35.8 
 
 		 1252 aa  623  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000270915  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002382  hypothetical protein  31.04 
 
 		 1508 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0402  MSHA biogenesis protein MshQ  30.83 
 
 		 900 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0473177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3755  PA14 domain-containing protein  32.01 
 
 		 1382 aa  271  7e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111574  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0557  MSHA biogenesis protein MshQ  28.66 
 
 		 906 aa  262  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0109211  normal  0.590942 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  30.5 
 
 		 1306 aa  231  5e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  37.53 
 
 		 1072 aa  226  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1504 aa  216  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0888  hypothetical protein  42.36 
 
 		 1191 aa  191  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.199681 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3101  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1133 aa  179  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  40.75 
 
 		 1202 aa  178  7e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0765  hypothetical protein  30.6 
 
 		 1085 aa  177  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232029  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00263  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshQ (pilus type IV)  27.61 
 
 		 1168 aa  169  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  24.47 
 
 		 1576 aa  141  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0182  CUB domain-containing protein  24.5 
 
 		 1537 aa  134  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384689  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  35 
 
 		 2642 aa  122  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03686  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1544 aa  94  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  35 
 
 		 900 aa  89.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  27.11 
 
 		 4896 aa  83.2  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  39.1 
 
 		 3911 aa  73.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  33.33 
 
 		 1111 aa  70.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001507  MSHA biogenesis protein MshQ  25.84 
 
 		 1008 aa  63.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101461  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  29.34 
 
 		 1127 aa  61.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05444  hypothetical protein  22.36 
 
 		 793 aa  47.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>