83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2801 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  100 
 
 
900 aa  1784    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  48.08 
 
 
1129 aa  429  1e-119  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2441  hypothetical protein  42.62 
 
 
643 aa  344  5e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  37.91 
 
 
4896 aa  224  6e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  35.97 
 
 
2642 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3335  hypothetical protein  37.65 
 
 
1553 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.545908  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3739  hypothetical protein  36.61 
 
 
1532 aa  115  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3823  hypothetical protein  35.19 
 
 
1541 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.473732  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  38.89 
 
 
1332 aa  108  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  30.58 
 
 
3911 aa  107  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0521  hypothetical protein  34.49 
 
 
1543 aa  107  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.402104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  38.21 
 
 
1059 aa  106  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0496  hypothetical protein  34.49 
 
 
1543 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0848067  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0517  hypothetical protein  34.49 
 
 
1543 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2833  hypothetical protein  35.04 
 
 
1252 aa  104  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000270915  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4100  MSHA biogenesis protein MshQ  33.46 
 
 
1257 aa  98.2  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3649  MSHA biogenesis protein MshQ  37.08 
 
 
1248 aa  96.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516469  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5942  conserved repeat domain protein  27.09 
 
 
2412 aa  96.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  36.19 
 
 
1202 aa  95.9  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0888  hypothetical protein  35.63 
 
 
1191 aa  96.3  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.199681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  31.03 
 
 
1127 aa  95.5  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0478  MSHA biogenesis protein MshQ  35.83 
 
 
1255 aa  95.5  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233703  normal  0.793103 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0573  MSHA biogenesis protein MshQ  34.9 
 
 
1258 aa  93.2  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0117136  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0407  hypothetical protein  28.2 
 
 
1285 aa  89.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.480631  hitchhiker  0.000026905 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3473  MSHA biogenesis protein MshQ  31.75 
 
 
1261 aa  89  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.928372 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4403  hypothetical protein  33.65 
 
 
1463 aa  87  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  30.31 
 
 
1111 aa  86.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  34.59 
 
 
1898 aa  82.4  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  36.59 
 
 
1441 aa  78.6  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002382  hypothetical protein  28.17 
 
 
1508 aa  76.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1516  hypothetical protein  25.32 
 
 
1236 aa  67  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0752  conserved repeat domain-containing protein  30.12 
 
 
897 aa  67.4  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.389587  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1798  hypothetical protein  27.07 
 
 
1482 aa  65.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1517  hypothetical protein  27.41 
 
 
1230 aa  65.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  28.22 
 
 
3373 aa  65.1  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3020  hypothetical protein  26.08 
 
 
1482 aa  64.3  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3138  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.06 
 
 
1469 aa  63.9  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  30.41 
 
 
1946 aa  63.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  39.58 
 
 
1263 aa  62  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  29.17 
 
 
5203 aa  61.2  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  36.8 
 
 
3471 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  25.21 
 
 
2656 aa  57.8  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5389  surface protein, lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  25.85 
 
 
939 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  34.85 
 
 
2573 aa  56.6  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  40.22 
 
 
2886 aa  55.1  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 
983 aa  55.1  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5332  cell wall anchor domain-containing protein  28.92 
 
 
975 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  37.12 
 
 
1227 aa  54.3  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  26.71 
 
 
2047 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4949  hypothetical protein  25.37 
 
 
509 aa  52.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.780389  normal  0.562948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  28.03 
 
 
5166 aa  52  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3119  hypothetical protein  34.34 
 
 
409 aa  51.6  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  27.75 
 
 
2118 aa  51.2  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  35.88 
 
 
1989 aa  50.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  32.5 
 
 
1108 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0667  hypothetical protein  32.31 
 
 
284 aa  50.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.930105  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1327  hypothetical protein  33.72 
 
 
354 aa  50.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178227  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  31.37 
 
 
2000 aa  50.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  32.34 
 
 
5517 aa  50.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  29.08 
 
 
2990 aa  48.9  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36150  putative collagen-binding protein  33.64 
 
 
727 aa  48.9  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  29.3 
 
 
1537 aa  49.3  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  28.16 
 
 
1857 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  28.16 
 
 
2121 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  35.07 
 
 
826 aa  47.8  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  35.61 
 
 
726 aa  48.1  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  34.29 
 
 
1293 aa  48.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  37.93 
 
 
2853 aa  47.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  36.55 
 
 
907 aa  47.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5944  conserved repeat domain protein  26.27 
 
 
969 aa  46.6  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  35.37 
 
 
5010 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0405  hypothetical protein  26.52 
 
 
977 aa  46.6  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510734  normal  0.0110299 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  28.7 
 
 
3634 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  30.49 
 
 
2520 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  38.06 
 
 
775 aa  45.8  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  29.02 
 
 
3394 aa  46.2  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  25.21 
 
 
8918 aa  46.2  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  36.25 
 
 
5017 aa  45.8  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  35.37 
 
 
5017 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  36.25 
 
 
5017 aa  45.8  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  35 
 
 
5010 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  32.93 
 
 
5010 aa  44.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  33.33 
 
 
1202 aa  44.3  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>