11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1516 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1516  hypothetical protein  100 
 
 
1236 aa  2447    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3020  hypothetical protein  97.94 
 
 
1482 aa  875    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3138  parallel beta-helix repeat-containing protein  85.44 
 
 
1469 aa  1753    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1517  hypothetical protein  50.61 
 
 
1230 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1798  hypothetical protein  50.61 
 
 
1482 aa  475  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5942  conserved repeat domain protein  31.3 
 
 
2412 aa  163  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0407  hypothetical protein  28.74 
 
 
1285 aa  125  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.480631  hitchhiker  0.000026905 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1064  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.63 
 
 
2064 aa  100  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.192438  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  26.06 
 
 
1129 aa  81.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  26.05 
 
 
900 aa  80.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2441  hypothetical protein  25.46 
 
 
643 aa  55.5  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>