119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1068 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  100 
 
 		 5166 aa  10060    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  84.69 
 
 		 5203 aa  8326    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  36.31 
 
 		 5517 aa  620  1e-175  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  39.19 
 
 		 3373 aa  547  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  39.02 
 
 		 2047 aa  399  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  33.41 
 
 		 2990 aa  321  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  28.84 
 
 		 5544 aa  315  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  33.81 
 
 		 2604 aa  310  6e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  35.89 
 
 		 1243 aa  247  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3048  Cna B-type  30.44 
 
 		 733 aa  234  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.938472  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  32.46 
 
 		 2656 aa  233  9e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  33.1 
 
 		 1337 aa  228  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  33.1 
 
 		 1337 aa  228  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  42.15 
 
 		 1263 aa  221  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  30.66 
 
 		 8918 aa  210  7e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  29.84 
 
 		 2112 aa  207  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  35.53 
 
 		 733 aa  203  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  36.71 
 
 		 3714 aa  201  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3498  Cna B-type  25.55 
 
 		 1531 aa  194  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149942  normal  0.725774 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  29.81 
 
 		 3508 aa  187  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  30.12 
 
 		 2890 aa  186  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  29.34 
 
 		 2876 aa  186  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  33.91 
 
 		 1727 aa  183  9e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2703  Cna B domain protein  36.84 
 
 		 586 aa  163  7e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000547211  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  29.3 
 
 		 3394 aa  160  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  35.28 
 
 		 1153 aa  151  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  35.28 
 
 		 1153 aa  151  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  37.63 
 
 		 965 aa  127  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  37.63 
 
 		 965 aa  127  6e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  35.52 
 
 		 3324 aa  127  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3630  hypothetical protein  34.75 
 
 		 940 aa  125  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  25.92 
 
 		 3816 aa  123  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1665 aa  123  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  27.52 
 
 		 2853 aa  114  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4196  conserved repeat domain protein  35.03 
 
 		 666 aa  113  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00838745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0506  hypothetical protein  34.28 
 
 		 941 aa  110  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0857444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  34.67 
 
 		 892 aa  107  7e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  30.19 
 
 		 1519 aa  104  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  33.23 
 
 		 1809 aa  100  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  26.8 
 
 		 2573 aa  99  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0765  hypothetical protein  26.41 
 
 		 1624 aa  98.6  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0595107  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  43.48 
 
 		 1118 aa  88.2  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4324  conserved repeat domain protein  33.01 
 
 		 436 aa  83.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0938  hypothetical protein  32.77 
 
 		 586 aa  79.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000915423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  27.75 
 
 		 2886 aa  79.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  40.17 
 
 		 807 aa  77.8  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1868  Cna B domain-containing protein  34.05 
 
 		 870 aa  73.9  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2930  prophage MuMc02, head decoration protein, putative  42.86 
 
 		 466 aa  72.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100371  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  42.52 
 
 		 1537 aa  72.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  42.28 
 
 		 3634 aa  70.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3154  Ricin B lectin  31.67 
 
 		 382 aa  66.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1223  hypothetical protein  39.47 
 
 		 263 aa  65.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.241489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0155  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  46.48 
 
 		 502 aa  61.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4110  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  26.89 
 
 		 753 aa  61.2  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.61298 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  40.5 
 
 		 2121 aa  60.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  40.5 
 
 		 1857 aa  60.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2122  hypothetical protein  38.28 
 
 		 892 aa  59.7  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0852106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0184  hypothetical protein  54.84 
 
 		 917 aa  60.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.217652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2319  hypothetical protein  33.06 
 
 		 914 aa  60.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.459489  normal  0.240278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5514  hypothetical protein  31 
 
 		 1504 aa  58.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5206  collagen adhesion protein  25.67 
 
 		 1102 aa  57.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  25.13 
 
 		 3393 aa  58.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  25.13 
 
 		 3486 aa  58.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6958  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  38.68 
 
 		 371 aa  58.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2490  hypothetical protein  38.89 
 
 		 745 aa  57.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0117  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.45 
 
 		 1336 aa  57.4  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750055  normal  0.74938 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  41.49 
 
 		 689 aa  57  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4007  hypothetical protein  39.45 
 
 		 1134 aa  57  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.842426  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  45.59 
 
 		 714 aa  55.5  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  44.12 
 
 		 440 aa  56.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  35.96 
 
 		 491 aa  56.2  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  26.16 
 
 		 1508 aa  55.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4309  hypothetical protein  35.54 
 
 		 940 aa  55.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0635002  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  25.24 
 
 		 5017 aa  54.7  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2556  Ricin B lectin  33.14 
 
 		 382 aa  54.7  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.676304  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0015  hypothetical protein  36.05 
 
 		 531 aa  54.3  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0181047  normal  0.128631 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1867  Cna B domain-containing protein  35.24 
 
 		 130 aa  54.3  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  43.4 
 
 		 1150 aa  53.9  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2320  hypothetical protein  43.28 
 
 		 916 aa  53.9  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0234116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  33.04 
 
 		 501 aa  53.9  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  38.14 
 
 		 2113 aa  52.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  40.95 
 
 		 2520 aa  52.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  28.34 
 
 		 900 aa  52.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  37.6 
 
 		 2000 aa  52  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  45.28 
 
 		 1168 aa  52  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  37.33 
 
 		 1314 aa  52  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  28.57 
 
 		 924 aa  51.6  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  25.23 
 
 		 3190 aa  51.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  41.24 
 
 		 1984 aa  51.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  48.08 
 
 		 813 aa  51.2  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  26.92 
 
 		 688 aa  51.2  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36150  putative collagen-binding protein  28.27 
 
 		 727 aa  51.2  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  36.63 
 
 		 440 aa  50.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  47.42 
 
 		 554 aa  50.8  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  37.29 
 
 		 1533 aa  50.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  36.75 
 
 		 2520 aa  50.4  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  27.14 
 
 		 1757 aa  50.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1282  Cna B domain-containing protein  39.33 
 
 		 248 aa  50.1  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.204415  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4150  Ricin B lectin  34.88 
 
 		 333 aa  50.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.536869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6957  hypothetical protein  37.36 
 
 		 372 aa  49.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.701404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>