88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3080 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  76.53 
 
 		 2886 aa  4316    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  100 
 
 		 2853 aa  5651    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  39.56 
 
 		 1809 aa  412  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  42.41 
 
 		 1441 aa  267  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  42.41 
 
 		 1898 aa  266  4e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  40.74 
 
 		 1946 aa  259  6e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  40.4 
 
 		 3486 aa  206  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  38.3 
 
 		 3634 aa  206  7e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  37.99 
 
 		 2078 aa  202  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  30.46 
 
 		 2487 aa  134  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  30.24 
 
 		 2490 aa  133  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  32.07 
 
 		 2358 aa  132  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  32.01 
 
 		 2490 aa  132  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  32.07 
 
 		 2358 aa  132  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  32.01 
 
 		 2490 aa  132  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  32.53 
 
 		 2490 aa  127  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  32.82 
 
 		 2490 aa  121  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  28.62 
 
 		 2520 aa  116  5e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  31.55 
 
 		 2489 aa  116  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  30.42 
 
 		 5166 aa  113  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  27.42 
 
 		 2520 aa  113  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  27.37 
 
 		 2434 aa  112  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.83 
 
 		 3816 aa  108  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  28.4 
 
 		 2121 aa  106  8e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  30.97 
 
 		 2113 aa  103  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  27.57 
 
 		 5203 aa  102  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  29.42 
 
 		 2490 aa  102  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  28.87 
 
 		 5010 aa  99.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  30.06 
 
 		 2118 aa  99  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  28.17 
 
 		 2418 aa  98.2  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  28.4 
 
 		 5017 aa  97.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  25.33 
 
 		 2573 aa  97.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  27.78 
 
 		 5010 aa  97.1  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  28.05 
 
 		 5017 aa  95.9  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  28.05 
 
 		 5017 aa  95.9  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  30.44 
 
 		 1533 aa  95.5  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  30.68 
 
 		 1857 aa  94.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  27.87 
 
 		 5017 aa  94.4  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  32.11 
 
 		 2485 aa  94  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  28.22 
 
 		 5017 aa  93.6  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  29.55 
 
 		 2000 aa  93.2  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3693  hypothetical protein  28.67 
 
 		 429 aa  89.4  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0765  hypothetical protein  26.24 
 
 		 1624 aa  88.2  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0595107  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  28.18 
 
 		 1984 aa  86.7  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1060  conserved repeat domain protein  46.91 
 
 		 4897 aa  86.3  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  28.12 
 
 		 5010 aa  85.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5332  cell wall anchor domain-containing protein  24.06 
 
 		 975 aa  84.3  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05162  hypothetical protein  46.25 
 
 		 3771 aa  82  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  33.86 
 
 		 924 aa  80.9  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0661  hypothetical protein  42.5 
 
 		 3360 aa  77.4  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5389  surface protein, lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  23.59 
 
 		 939 aa  77  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4949  hypothetical protein  28.19 
 
 		 509 aa  76.3  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.780389  normal  0.562948 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  28.99 
 
 		 1757 aa  76.3  0.000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  30.22 
 
 		 5010 aa  74.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3075  outer membrane adhesin like proteiin  24.96 
 
 		 3508 aa  72.8  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1580 aa  72.8  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  25.86 
 
 		 3394 aa  67.4  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 		 1293 aa  67  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  24.82 
 
 		 1108 aa  65.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5407  hypothetical protein  26.88 
 
 		 3714 aa  64.7  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  24.42 
 
 		 8918 aa  63.9  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  28.57 
 
 		 898 aa  62.4  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  29.59 
 
 		 1702 aa  61.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  21.99 
 
 		 3471 aa  61.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  25.82 
 
 		 1118 aa  60.5  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  21.78 
 
 		 3521 aa  60.1  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  26.29 
 
 		 4896 aa  58.2  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  24.57 
 
 		 3911 aa  56.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  26.56 
 
 		 909 aa  55.5  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0147  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  24 
 
 		 2724 aa  55.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0023  hypothetical protein  27.22 
 
 		 2233 aa  55.5  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  21.2 
 
 		 3409 aa  54.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2435  hypothetical protein  30.85 
 
 		 689 aa  53.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  29.11 
 
 		 3921 aa  52.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  32.71 
 
 		 3472 aa  51.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  24.94 
 
 		 1332 aa  52  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3701  conserved repeat domain protein  36.54 
 
 		 194 aa  50.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  29.07 
 
 		 807 aa  49.7  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1537 aa  48.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1214 aa  48.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2418  hypothetical protein  22.33 
 
 		 1019 aa  48.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4798  cell surface protein, anchor  32.71 
 
 		 2025 aa  48.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  23 
 
 		 1059 aa  47.8  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1806  hypothetical protein  28.57 
 
 		 621 aa  47.8  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  38.37 
 
 		 900 aa  47.4  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  30.45 
 
 		 440 aa  46.6  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1624  ABC-type sugar transport systems permease components-like protein  35.8 
 
 		 503 aa  46.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180215  normal  0.289287 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1202 aa  46.2  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>