More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3254 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  100 
 
 		 2118 aa  4304    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  36.64 
 
 		 1702 aa  631  1e-179  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  29.19 
 
 		 2000 aa  317  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  28.73 
 
 		 1984 aa  305  5.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  26.29 
 
 		 2434 aa  260  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  25.9 
 
 		 2418 aa  256  5.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  26.2 
 
 		 1757 aa  252  4e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  26.66 
 
 		 1580 aa  186  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4948  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1278 aa  165  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3079  OmpA/MotB domain-containing protein  26.25 
 
 		 1700 aa  157  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0046  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1260 aa  153  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.744748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2415  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1260 aa  153  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.633946  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2392  OmpA/MotB  28.6 
 
 		 1402 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.337578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0436  OmpA/MotB domain protein  31.61 
 
 		 1709 aa  139  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05163  hypothetical protein  23.47 
 
 		 1171 aa  116  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3404  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1175 aa  114  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.24888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3669  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1175 aa  111  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3574  hypothetical protein  29.29 
 
 		 1140 aa  103  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  29.26 
 
 		 2853 aa  101  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1809 aa  97.8  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1061  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1222 aa  94.4  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0660  hypothetical protein  27.38 
 
 		 1171 aa  94  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4949  hypothetical protein  28.34 
 
 		 509 aa  90.5  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.780389  normal  0.562948 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  32.73 
 
 		 2886 aa  89.4  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0023  hypothetical protein  29.47 
 
 		 2233 aa  87  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  56.96 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1819  OmpA domain-containing protein  41.44 
 
 		 179 aa  78.6  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.246391  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20420  conserved repeat domain protein  25.62 
 
 		 1248 aa  77.4  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0750  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1861 aa  75.5  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  51.72 
 
 		 447 aa  75.5  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1973  chemotaxis protein MotB  44.83 
 
 		 299 aa  72.8  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  51.22 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  50 
 
 		 429 aa  71.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1861  hypothetical protein  27.62 
 
 		 1143 aa  71.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.701379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  28.03 
 
 		 1441 aa  71.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  52.5 
 
 		 433 aa  70.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0693  OmpA/MotB  41.96 
 
 		 166 aa  70.9  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  33.89 
 
 		 3486 aa  70.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  52.5 
 
 		 433 aa  70.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2435  hypothetical protein  30.92 
 
 		 689 aa  70.9  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  52.5 
 
 		 433 aa  70.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  38.66 
 
 		 414 aa  70.5  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0354  OmpA/MotB domain-containing protein  33.1 
 
 		 236 aa  69.7  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  33 
 
 		 909 aa  69.7  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  40.17 
 
 		 237 aa  69.3  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  44.44 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  48.75 
 
 		 421 aa  68.9  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  48.75 
 
 		 426 aa  68.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  45.68 
 
 		 406 aa  68.6  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  38.33 
 
 		 305 aa  68.6  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  48.75 
 
 		 421 aa  68.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  48.75 
 
 		 421 aa  68.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  48.75 
 
 		 421 aa  68.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1898 aa  68.6  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  48.75 
 
 		 421 aa  68.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  48.75 
 
 		 421 aa  68.9  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1874  OmpA/MotB domain-containing protein  48.15 
 
 		 366 aa  67.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0773204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0231  flagellar MotB protein  48.15 
 
 		 366 aa  67.8  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6475  OmpA/MotB domain protein  31.97 
 
 		 285 aa  67.8  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.38145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  29.63 
 
 		 1946 aa  68.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  44.74 
 
 		 453 aa  68.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1395  OmpA/MotB domain-containing protein  46.91 
 
 		 367 aa  67.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.616253  normal  0.476019 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  50 
 
 		 434 aa  67.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6618  OmpA/MotB domain-containing protein  39.34 
 
 		 248 aa  67.4  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.978639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  50 
 
 		 433 aa  67  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  46.25 
 
 		 443 aa  66.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  48.75 
 
 		 469 aa  66.6  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  26.35 
 
 		 3634 aa  66.6  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3084  putative outer membrane lipoprotein  37.27 
 
 		 161 aa  66.6  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  35.77 
 
 		 256 aa  66.2  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  46.99 
 
 		 463 aa  66.6  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1073  OmpA/MotB domain protein  36.94 
 
 		 257 aa  65.9  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  41.25 
 
 		 275 aa  65.9  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  43.21 
 
 		 258 aa  65.9  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  47.5 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.5 
 
 		 1726 aa  65.9  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  48.75 
 
 		 415 aa  65.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  42.11 
 
 		 449 aa  65.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2465  flagellar motor protein MotB  31.76 
 
 		 251 aa  65.5  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0986  flagellar motor protein MotB  34.43 
 
 		 259 aa  65.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  48.75 
 
 		 432 aa  65.5  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  42.11 
 
 		 449 aa  65.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  46.84 
 
 		 494 aa  65.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2800  protein of unknown function DUF11  21.83 
 
 		 1861 aa  65.1  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.515437  normal  0.451772 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  26.32 
 
 		 2078 aa  64.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  47.25 
 
 		 434 aa  64.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  45.12 
 
 		 254 aa  64.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0661  hypothetical protein  30.23 
 
 		 3360 aa  64.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  47.25 
 
 		 434 aa  64.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  47.25 
 
 		 434 aa  64.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2266  hypothetical protein  41.23 
 
 		 212 aa  63.9  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  49.37 
 
 		 493 aa  64.3  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5082  hypothetical protein  41.23 
 
 		 217 aa  63.9  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.343747  normal  0.389351 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  46.15 
 
 		 434 aa  63.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  47.5 
 
 		 410 aa  63.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2022  OmpA/MotB domain-containing protein  39.5 
 
 		 252 aa  63.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0243984  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12418  putative flagellar motor protein MotB  45.57 
 
 		 286 aa  63.2  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.642287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  40 
 
 		 240 aa  63.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  30.24 
 
 		 924 aa  63.2  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  41.77 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>