92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0048 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  48.82 
 
 
1441 aa  718    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  62.75 
 
 
1898 aa  1000    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  100 
 
 
1946 aa  3864    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  44.04 
 
 
1809 aa  288  5e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  38.61 
 
 
2078 aa  274  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  38.12 
 
 
3634 aa  273  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  40.74 
 
 
2853 aa  259  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  40.43 
 
 
2886 aa  256  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  34.81 
 
 
3486 aa  235  6e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3020  hypothetical protein  43.75 
 
 
1482 aa  195  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  27.19 
 
 
2358 aa  97.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  27.04 
 
 
2358 aa  96.3  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  27.04 
 
 
2490 aa  96.3  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  26.38 
 
 
2490 aa  92.8  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  27.2 
 
 
2485 aa  92  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  27.3 
 
 
2490 aa  91.3  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  27.33 
 
 
2490 aa  90.5  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  29.75 
 
 
8918 aa  90.1  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  27.16 
 
 
2487 aa  89.4  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  26.71 
 
 
2489 aa  88.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  26.59 
 
 
2490 aa  88.6  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05162  hypothetical protein  42.06 
 
 
3771 aa  87.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  27.19 
 
 
2490 aa  87  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0661  hypothetical protein  46.25 
 
 
3360 aa  84.7  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  30.27 
 
 
1332 aa  78.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24760  conserved repeat protein  31.96 
 
 
1516 aa  78.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.216781 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  26.56 
 
 
1757 aa  76.6  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  28.33 
 
 
2434 aa  76.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  29.32 
 
 
1118 aa  75.5  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4949  hypothetical protein  29.44 
 
 
509 aa  74.3  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.780389  normal  0.562948 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  33.68 
 
 
1984 aa  74.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  32.22 
 
 
1059 aa  73.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  28.92 
 
 
900 aa  73.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1060  conserved repeat domain protein  44.16 
 
 
4897 aa  73.2  0.00000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  30.95 
 
 
2000 aa  72.4  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  23.86 
 
 
2520 aa  70.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  25.79 
 
 
1580 aa  70.1  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  24.85 
 
 
2520 aa  70.1  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  27.21 
 
 
2113 aa  69.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  33.01 
 
 
1702 aa  69.7  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  27.38 
 
 
1533 aa  69.7  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  29.63 
 
 
2118 aa  67.8  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  24.17 
 
 
1508 aa  66.6  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  25.75 
 
 
5017 aa  64.7  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  25.24 
 
 
5017 aa  63.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  25.24 
 
 
5017 aa  63.9  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  24.2 
 
 
5010 aa  63.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  26.03 
 
 
1857 aa  63.9  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  24.88 
 
 
5017 aa  62.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  29.35 
 
 
3471 aa  62.4  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  26.73 
 
 
2121 aa  62  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  28.05 
 
 
2418 aa  61.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  22.22 
 
 
3471 aa  61.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  27.85 
 
 
757 aa  62  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  24.92 
 
 
5017 aa  59.7  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  23.62 
 
 
5010 aa  59.3  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  27.9 
 
 
1003 aa  58.9  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  42.74 
 
 
1989 aa  58.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  21.82 
 
 
3521 aa  58.2  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  37.84 
 
 
1665 aa  57.8  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06004  hypothetical protein  27.51 
 
 
702 aa  57.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  25.05 
 
 
5010 aa  57  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  38.14 
 
 
3191 aa  56.6  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  38.18 
 
 
3921 aa  55.8  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  27.67 
 
 
909 aa  55.5  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  34.04 
 
 
4896 aa  55.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  33.54 
 
 
2912 aa  54.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  24.95 
 
 
5010 aa  54.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  43.01 
 
 
2487 aa  54.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  33.97 
 
 
1537 aa  53.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  21.23 
 
 
3472 aa  54.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1517  hypothetical protein  24.28 
 
 
1230 aa  53.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2435  hypothetical protein  32.12 
 
 
689 aa  53.1  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  26.09 
 
 
924 aa  53.1  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  33.12 
 
 
898 aa  52.8  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  29.52 
 
 
2573 aa  52  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  38.54 
 
 
1263 aa  51.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4228  conserved repeat domain protein  29.4 
 
 
2395 aa  52  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.687969 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  33.73 
 
 
983 aa  51.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  25.78 
 
 
3911 aa  51.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  36.72 
 
 
5203 aa  51.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1237  hypothetical protein  24.22 
 
 
719 aa  50.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1806  hypothetical protein  29.83 
 
 
621 aa  49.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000485  hypothetical protein  29.2 
 
 
667 aa  49.7  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.889431  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  26.54 
 
 
3920 aa  48.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  28.71 
 
 
3373 aa  48.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  36.78 
 
 
1293 aa  47.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  28.86 
 
 
726 aa  47.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  22.13 
 
 
3409 aa  47  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  33.85 
 
 
1227 aa  47  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4798  cell surface protein, anchor  22.81 
 
 
2025 aa  46.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  25.71 
 
 
440 aa  46.6  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>