82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4277 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  100 
 
 
1227 aa  2427    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  40.48 
 
 
1202 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  30.08 
 
 
1537 aa  272  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  29.98 
 
 
3634 aa  271  8e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  28.69 
 
 
1293 aa  154  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  27.09 
 
 
3471 aa  144  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  32.07 
 
 
983 aa  128  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  29.55 
 
 
744 aa  125  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  26.36 
 
 
1809 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  29.89 
 
 
2573 aa  121  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  30.16 
 
 
3921 aa  116  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  32.99 
 
 
1989 aa  107  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  29.27 
 
 
4896 aa  104  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  25.91 
 
 
3602 aa  91.7  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  28.34 
 
 
1332 aa  89.7  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  30.58 
 
 
2121 aa  85.1  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4941  hypothetical protein  30.55 
 
 
845 aa  82  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0859388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  30.42 
 
 
1150 aa  77.8  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2969  hypothetical protein  29.82 
 
 
574 aa  77  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.070385  hitchhiker  0.0000379477 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  24.66 
 
 
2490 aa  76.3  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  23.92 
 
 
2490 aa  75.9  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  31.01 
 
 
1168 aa  75.5  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  37.67 
 
 
726 aa  72  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  24.82 
 
 
2358 aa  71.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  26.98 
 
 
5010 aa  71.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  24.82 
 
 
2358 aa  71.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  25.44 
 
 
5017 aa  70.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  26.09 
 
 
5010 aa  70.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  27.71 
 
 
1059 aa  67.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  25.75 
 
 
2490 aa  67.4  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  25.55 
 
 
2490 aa  66.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  24.28 
 
 
2490 aa  66.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  25.72 
 
 
2487 aa  65.5  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  28.19 
 
 
1118 aa  64.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  23.82 
 
 
2520 aa  63.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  24.44 
 
 
2485 aa  63.2  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  23.63 
 
 
2113 aa  61.6  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  23.74 
 
 
5017 aa  60.1  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  23.74 
 
 
5017 aa  60.1  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  34.56 
 
 
587 aa  60.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  23.63 
 
 
2520 aa  59.7  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  28.01 
 
 
1857 aa  59.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  25.05 
 
 
5010 aa  58.9  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  26.41 
 
 
2490 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  35 
 
 
826 aa  57.8  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  32.48 
 
 
3191 aa  57.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3119  hypothetical protein  33.88 
 
 
409 aa  57.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  25.76 
 
 
5017 aa  57  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  26.73 
 
 
3209 aa  57.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  22.51 
 
 
2489 aa  57.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  20.36 
 
 
3472 aa  57  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  22.6 
 
 
1533 aa  56.6  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  24.76 
 
 
5017 aa  56.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  30.41 
 
 
5010 aa  56.6  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 
3324 aa  56.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  20.89 
 
 
3521 aa  56.2  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  28.45 
 
 
2000 aa  55.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  34.16 
 
 
907 aa  54.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  23.26 
 
 
1519 aa  53.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  37.12 
 
 
900 aa  53.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  22.01 
 
 
3409 aa  51.6  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1410  hypothetical protein  30.25 
 
 
1038 aa  51.6  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2001  conserved repeat domain protein  35.04 
 
 
419 aa  51.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  23.88 
 
 
2886 aa  51.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0886  hypothetical protein  38.95 
 
 
827 aa  51.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1927  hypothetical protein  26.35 
 
 
2748 aa  50.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3255  hypothetical protein  28.91 
 
 
612 aa  49.7  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  29.5 
 
 
807 aa  49.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2348  hypothetical protein  38.53 
 
 
545 aa  49.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5377  hypothetical protein  26.35 
 
 
580 aa  48.9  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0233542  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  31.97 
 
 
2487 aa  48.5  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  39.19 
 
 
801 aa  48.5  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2970  hypothetical protein  34.38 
 
 
167 aa  48.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0032208  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1060  conserved repeat domain protein  25.81 
 
 
4897 aa  47.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  26.75 
 
 
909 aa  47.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2775  hypothetical protein  34.19 
 
 
1182 aa  46.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.465678  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  22.49 
 
 
3471 aa  46.2  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  28.23 
 
 
1757 aa  45.8  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  25.58 
 
 
2912 aa  45.4  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  28.93 
 
 
1984 aa  45.4  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  33.33 
 
 
644 aa  45.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05162  hypothetical protein  29.65 
 
 
3771 aa  45.1  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>