65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0751 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  52.95 
 
 
898 aa  843    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  100 
 
 
909 aa  1828    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  36 
 
 
924 aa  402  9.999999999999999e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  29.93 
 
 
2000 aa  121  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2435  hypothetical protein  35.29 
 
 
689 aa  114  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0752  conserved repeat domain-containing protein  30.83 
 
 
897 aa  108  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.389587  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  29.78 
 
 
1984 aa  107  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2432  hypothetical protein  27.04 
 
 
722 aa  83.6  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.160714  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  32.47 
 
 
3486 aa  80.5  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  33 
 
 
2118 aa  77.4  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  29.95 
 
 
2434 aa  76.6  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  27.73 
 
 
1441 aa  74.7  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  32.81 
 
 
1898 aa  71.2  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  22.56 
 
 
2490 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  24.3 
 
 
1757 aa  65.5  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  26.53 
 
 
1580 aa  63.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  33.18 
 
 
440 aa  61.6  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  32.28 
 
 
2853 aa  61.2  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  27.08 
 
 
2418 aa  61.2  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  21.75 
 
 
5017 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  30.43 
 
 
5517 aa  58.9  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  29.39 
 
 
2490 aa  58.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  28.07 
 
 
2487 aa  57  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  29.39 
 
 
2490 aa  57  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  29.38 
 
 
1809 aa  55.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  30.83 
 
 
2886 aa  56.2  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  27.88 
 
 
2485 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  27.75 
 
 
1946 aa  55.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  28.07 
 
 
2490 aa  55.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  28.07 
 
 
2490 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  26.36 
 
 
2358 aa  53.5  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20420  conserved repeat domain protein  28.7 
 
 
1248 aa  53.5  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  29.32 
 
 
2573 aa  53.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  26.36 
 
 
2358 aa  53.5  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  26.37 
 
 
3911 aa  52.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  27.36 
 
 
4896 aa  52  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  25.44 
 
 
2489 aa  51.6  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0193  hypothetical protein  29.82 
 
 
347 aa  51.2  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0116004  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  26.09 
 
 
3373 aa  50.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1264  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 
686 aa  50.1  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  24.84 
 
 
1118 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  26.1 
 
 
5010 aa  50.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  26.51 
 
 
8918 aa  49.3  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  21.54 
 
 
5010 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  28.16 
 
 
2490 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  22.31 
 
 
5010 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  27.19 
 
 
3634 aa  48.5  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  27.41 
 
 
2078 aa  48.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  28.84 
 
 
807 aa  48.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  28.93 
 
 
983 aa  48.1  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  29.8 
 
 
2713 aa  48.1  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  29.61 
 
 
2121 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  24.55 
 
 
1202 aa  46.6  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  28.73 
 
 
2520 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  22.22 
 
 
2520 aa  46.2  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  24.02 
 
 
2113 aa  46.2  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  37.93 
 
 
599 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4949  hypothetical protein  24.12 
 
 
509 aa  45.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.780389  normal  0.562948 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  26.8 
 
 
5017 aa  45.8  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  26.8 
 
 
5017 aa  45.8  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  26.14 
 
 
5017 aa  45.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  22.52 
 
 
1779 aa  45.4  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  21.18 
 
 
5010 aa  45.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  28.75 
 
 
5017 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  34.41 
 
 
775 aa  44.3  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>