73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3754 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3754  hypothetical protein  100 
 
 		 801 aa  1583    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.635488  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0886  hypothetical protein  35.15 
 
 		 827 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2594  hypothetical protein  62.41 
 
 		 347 aa  178  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0358  hypothetical protein  48.43 
 
 		 558 aa  137  5e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1072  hypothetical protein  31 
 
 		 725 aa  134  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1334  hypothetical protein  56.72 
 
 		 377 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.229502  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  44.09 
 
 		 1989 aa  124  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  36.32 
 
 		 3634 aa  89.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  36.26 
 
 		 2078 aa  89.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  41.11 
 
 		 2912 aa  82.8  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  37.43 
 
 		 3486 aa  83.2  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  35.15 
 
 		 1118 aa  77  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  33.04 
 
 		 3920 aa  72  0.00000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  45.98 
 
 		 826 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  31.31 
 
 		 2520 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  48.35 
 
 		 2573 aa  70.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  30.99 
 
 		 2520 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4610  hypothetical protein  24.32 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  29.68 
 
 		 2121 aa  68.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  35.23 
 
 		 2713 aa  67.4  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  32 
 
 		 4896 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  28.9 
 
 		 3921 aa  59.7  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  36.09 
 
 		 3191 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  33.06 
 
 		 726 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  39.33 
 
 		 2487 aa  59.3  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  36.27 
 
 		 1293 aa  59.3  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  40.95 
 
 		 775 aa  58.5  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  30.25 
 
 		 8918 aa  58.2  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  34.34 
 
 		 1150 aa  58.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  27.95 
 
 		 5017 aa  57.4  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  35.71 
 
 		 587 aa  56.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  42.7 
 
 		 1168 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  37.08 
 
 		 2490 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  32 
 
 		 2489 aa  56.6  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  34.83 
 
 		 2490 aa  54.3  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  45.83 
 
 		 1202 aa  53.9  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1665 aa  53.9  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  27.31 
 
 		 5017 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  35.96 
 
 		 2490 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  35.96 
 
 		 2485 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  35.96 
 
 		 2490 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  35.96 
 
 		 2490 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  35.96 
 
 		 2490 aa  53.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0059  hypothetical protein  42.03 
 
 		 444 aa  53.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.291896  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  35.96 
 
 		 2358 aa  53.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  35.96 
 
 		 2358 aa  53.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  37.5 
 
 		 5010 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  37.5 
 
 		 5010 aa  51.6  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3776  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.45 
 
 		 554 aa  50.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000930307  unclonable  0.00000981253 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  35.23 
 
 		 5010 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  27.06 
 
 		 5010 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  34.48 
 
 		 1857 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  35.23 
 
 		 5017 aa  49.3  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  28.26 
 
 		 5017 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  35.23 
 
 		 5017 aa  49.3  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  42.35 
 
 		 1519 aa  49.3  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  34.65 
 
 		 1750 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  39.33 
 
 		 983 aa  49.3  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  39.19 
 
 		 1227 aa  48.9  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  30.48 
 
 		 2487 aa  48.5  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  32.26 
 
 		 2113 aa  48.1  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3132  polymorphic membrane protein  40.66 
 
 		 546 aa  47.8  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  27.27 
 
 		 1533 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  25.33 
 
 		 1441 aa  47  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  42.65 
 
 		 3471 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0805  hypothetical protein  34.31 
 
 		 1021 aa  47  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265346  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3693  hypothetical protein  27.68 
 
 		 429 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1806  hypothetical protein  36.36 
 
 		 621 aa  46.6  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  40.22 
 
 		 1537 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  31.96 
 
 		 3602 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2970  hypothetical protein  47.06 
 
 		 167 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0032208  hitchhiker  0.0000171806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  47.06 
 
 		 744 aa  44.3  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0938  hypothetical protein  30.95 
 
 		 586 aa  43.9  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000915423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>