72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4244 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  73.43 
 
 		 1059 aa  1467    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  100 
 
 		 1332 aa  2618    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  49.14 
 
 		 1597 aa  441  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  49.71 
 
 		 1708 aa  427  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0808  laminin G, domain-containing 2  46.81 
 
 		 1746 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.412414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  32.7 
 
 		 3471 aa  237  9e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  31.15 
 
 		 4896 aa  221  7e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  29.61 
 
 		 983 aa  154  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  28.86 
 
 		 3921 aa  139  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  28.42 
 
 		 3602 aa  133  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  30.98 
 
 		 1293 aa  126  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  27.94 
 
 		 2573 aa  125  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1060  conserved repeat domain protein  26.19 
 
 		 4897 aa  117  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  30.86 
 
 		 1989 aa  109  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  38.89 
 
 		 900 aa  108  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  25.62 
 
 		 1118 aa  100  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  28.94 
 
 		 744 aa  96.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  25.79 
 
 		 1441 aa  94  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  25.78 
 
 		 1537 aa  82.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  26.24 
 
 		 1202 aa  81.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  28.88 
 
 		 1898 aa  78.2  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  27.23 
 
 		 1227 aa  77  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1809 aa  77  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0809  laminin G, domain-containing 2  36.67 
 
 		 209 aa  76.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.012094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  29.69 
 
 		 1946 aa  74.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  26.25 
 
 		 3634 aa  72.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  32.55 
 
 		 3191 aa  70.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  37.27 
 
 		 1263 aa  66.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1806  hypothetical protein  38.06 
 
 		 621 aa  64.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05162  hypothetical protein  21.39 
 
 		 3771 aa  64.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  25.22 
 
 		 3911 aa  62.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  28.44 
 
 		 3209 aa  62.4  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  30.8 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4951  hypothetical protein  26.15 
 
 		 3394 aa  61.6  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2969  hypothetical protein  27.45 
 
 		 574 aa  60.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.070385  hitchhiker  0.0000379477 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  28.35 
 
 		 2485 aa  57.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3119  hypothetical protein  32.26 
 
 		 409 aa  56.6  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  29.07 
 
 		 2000 aa  56.2  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  26.36 
 
 		 8918 aa  55.8  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  26.44 
 
 		 1150 aa  55.1  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  26.61 
 
 		 2490 aa  55.1  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  26.96 
 
 		 2490 aa  55.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  27.76 
 
 		 2487 aa  55.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  26.57 
 
 		 2490 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  28.53 
 
 		 5010 aa  52.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0667  hypothetical protein  32.16 
 
 		 284 aa  52.4  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.930105  normal  0.0924489 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  31.88 
 
 		 5010 aa  52  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  25.76 
 
 		 5010 aa  52  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  25 
 
 		 2490 aa  52  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  25.12 
 
 		 2358 aa  52  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  25.12 
 
 		 2358 aa  51.6  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  27.45 
 
 		 1519 aa  51.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0661  hypothetical protein  21.4 
 
 		 3360 aa  51.2  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  24.96 
 
 		 2489 aa  51.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  27.17 
 
 		 2490 aa  50.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  29.76 
 
 		 1984 aa  50.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4916  hypothetical protein  27.14 
 
 		 283 aa  48.9  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  26 
 
 		 5010 aa  48.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  24.07 
 
 		 2853 aa  48.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  23.75 
 
 		 898 aa  47.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0829  hypothetical protein  36 
 
 		 304 aa  47.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.368089  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  22.87 
 
 		 2490 aa  47  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  24.62 
 
 		 1168 aa  46.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  27.64 
 
 		 2713 aa  47  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5182  hypothetical protein  29.05 
 
 		 315 aa  46.6  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  29.22 
 
 		 924 aa  46.2  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3255  hypothetical protein  30.53 
 
 		 612 aa  46.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1260  hypothetical protein  29.53 
 
 		 272 aa  46.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550772  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4941  hypothetical protein  29.86 
 
 		 845 aa  45.8  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0859388 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1197  hypothetical protein  27.5 
 
 		 631 aa  45.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  31.25 
 
 		 587 aa  45.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11533  hypothetical protein  30.57 
 
 		 299 aa  45.1  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>