22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5182 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5182  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  660    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.990358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3839  hypothetical protein  49.5 
 
 		 311 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0319  hypothetical protein  46.15 
 
 		 309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.100373  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3215  hypothetical protein  41.67 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3750  hypothetical protein  41.16 
 
 		 307 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.261231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2565  hypothetical protein  37.23 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2303  hypothetical protein  32.27 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.4331 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2566  hypothetical protein  34.48 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.466202  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11533  hypothetical protein  35.03 
 
 		 299 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201975 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00205  hypothetical protein  32.17 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0708  hypothetical protein  32.08 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3317  hypothetical protein  30.82 
 
 		 313 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0829  hypothetical protein  30.35 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.368089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3426  hypothetical protein  30.16 
 
 		 309 aa  112  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.318047  normal  0.528642 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3847  hypothetical protein  26.93 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.743942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  26.55 
 
 		 1597 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  27.48 
 
 		 1708 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0808  laminin G, domain-containing 2  29.91 
 
 		 1746 aa  63.5  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.412414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1059 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0433  hypothetical protein  22.63 
 
 		 342 aa  53.1  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.233515  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  29.05 
 
 		 1332 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1397  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  21.15 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.20997  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>