66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2799 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  100 
 
 
898 aa  1790    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  52.95 
 
 
909 aa  832    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  38.31 
 
 
924 aa  441  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  30.62 
 
 
2000 aa  144  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  31.07 
 
 
1984 aa  137  9e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2435  hypothetical protein  36.12 
 
 
689 aa  110  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0752  conserved repeat domain-containing protein  28.38 
 
 
897 aa  95.5  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.389587  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  27.23 
 
 
1757 aa  78.6  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  25.94 
 
 
2434 aa  78.2  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  27.25 
 
 
3486 aa  77.8  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  27.45 
 
 
1580 aa  74.7  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2432  hypothetical protein  26.65 
 
 
722 aa  73.6  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.160714  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  25.61 
 
 
2418 aa  68.2  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4949  hypothetical protein  25.46 
 
 
509 aa  67.8  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.780389  normal  0.562948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  28.57 
 
 
2853 aa  66.2  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  31.84 
 
 
2487 aa  63.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  31 
 
 
2490 aa  63.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  31.68 
 
 
2490 aa  62.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  30.5 
 
 
2485 aa  62  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  28.57 
 
 
2118 aa  60.8  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  22.43 
 
 
2490 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0366  chromosome segregation ATPase-like protein  31.61 
 
 
1030 aa  60.1  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.641713  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  27.63 
 
 
1898 aa  59.3  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0581  conserved repeat domain protein  33.15 
 
 
880 aa  58.9  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  26.94 
 
 
2489 aa  58.5  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  31.58 
 
 
1441 aa  58.2  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  27.4 
 
 
2886 aa  58.2  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  26.62 
 
 
2490 aa  58.2  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  30.14 
 
 
2490 aa  58.2  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  30.14 
 
 
2490 aa  57.4  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  30.14 
 
 
2358 aa  57.4  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  30.14 
 
 
2358 aa  57.4  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  29.11 
 
 
2121 aa  55.8  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  29.54 
 
 
2520 aa  55.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0694  conserved repeat domain protein  26.29 
 
 
848 aa  55.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0143238  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  33.12 
 
 
1946 aa  54.7  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  27.62 
 
 
1702 aa  54.3  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1264  conserved repeat domain protein  36.9 
 
 
686 aa  51.2  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  26.67 
 
 
807 aa  50.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  31.03 
 
 
2520 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0705  conserved repeat domain protein  25.14 
 
 
847 aa  49.3  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.63202e-21 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  27.27 
 
 
3634 aa  49.3  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  26.47 
 
 
3602 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  27.27 
 
 
2078 aa  48.5  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  29.81 
 
 
1809 aa  48.1  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3593  hypothetical protein  32.99 
 
 
695 aa  48.1  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  23.75 
 
 
1332 aa  48.1  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  31.82 
 
 
744 aa  47.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  27.27 
 
 
5010 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  26.34 
 
 
5017 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  27.65 
 
 
5017 aa  46.6  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  31.9 
 
 
3921 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  27.65 
 
 
5017 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  20.66 
 
 
5010 aa  46.2  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  39.19 
 
 
5544 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  27.93 
 
 
1857 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  26.52 
 
 
2113 aa  45.4  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1210  conserved repeat domain protein  27.42 
 
 
617 aa  45.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.2077  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3227  hypothetical protein  25.16 
 
 
996 aa  45.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.640032  normal  0.507723 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  27.57 
 
 
5010 aa  45.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0661  hypothetical protein  25.33 
 
 
3360 aa  45.1  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0750  hypothetical protein  27.08 
 
 
1861 aa  44.7  0.008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  31.4 
 
 
1989 aa  44.3  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03680  conserved repeat protein  31.43 
 
 
693 aa  44.7  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.158433  normal  0.0107502 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  29.39 
 
 
1293 aa  44.3  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  31.74 
 
 
440 aa  44.3  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>