83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2393 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  100 
 
 
1809 aa  3640    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  39.1 
 
 
2853 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  36.78 
 
 
2886 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  44.04 
 
 
1946 aa  289  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  44.71 
 
 
1441 aa  281  8e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  44.71 
 
 
1898 aa  281  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  40.06 
 
 
2078 aa  230  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  40.06 
 
 
3634 aa  230  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  37.92 
 
 
3486 aa  201  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  31.91 
 
 
2434 aa  143  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  28.07 
 
 
1537 aa  134  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  31.28 
 
 
2418 aa  114  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  26.24 
 
 
3471 aa  109  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  25.28 
 
 
1202 aa  108  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1934  conserved repeat domain-containing protein  39.05 
 
 
1263 aa  107  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.426713  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  39.34 
 
 
5203 aa  100  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  38.78 
 
 
5166 aa  99.8  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  30.97 
 
 
2573 aa  96.3  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  33.82 
 
 
3373 aa  94.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  25.79 
 
 
1227 aa  93.6  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  27.7 
 
 
2118 aa  91.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  34.3 
 
 
1214 aa  90.9  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  27.46 
 
 
983 aa  87  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  31.99 
 
 
2047 aa  86.3  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3112  hypothetical protein  29.59 
 
 
744 aa  85.5  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0359338  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  26.93 
 
 
1293 aa  84.7  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  32.24 
 
 
2000 aa  82.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  25.48 
 
 
1580 aa  80.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  27.48 
 
 
3921 aa  79.7  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  31.78 
 
 
1984 aa  79  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  27.2 
 
 
1332 aa  77  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  31.4 
 
 
924 aa  74.7  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05162  hypothetical protein  43.42 
 
 
3771 aa  74.3  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  25.08 
 
 
3602 aa  73.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  26.92 
 
 
4896 aa  73.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0661  hypothetical protein  40.79 
 
 
3360 aa  72.4  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4949  hypothetical protein  28.69 
 
 
509 aa  72.4  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.780389  normal  0.562948 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0599  cell wall anchor domain-containing protein  35.07 
 
 
1337 aa  71.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0585  cell wall anchor domain-containing protein  35.07 
 
 
1337 aa  71.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1060  conserved repeat domain protein  40.24 
 
 
4897 aa  71.2  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  32.33 
 
 
3191 aa  70.1  0.0000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2969  hypothetical protein  32.89 
 
 
574 aa  67.4  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.070385  hitchhiker  0.0000379477 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0598  cell wall anchor domain-containing protein  34.62 
 
 
965 aa  65.5  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0584  cell wall anchor domain-containing protein  34.62 
 
 
965 aa  65.5  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  25.96 
 
 
1702 aa  65.1  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0600  cell wall anchor domain-containing protein  30.8 
 
 
1153 aa  63.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0586  cell wall anchor domain-containing protein  30.8 
 
 
1153 aa  63.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  32.09 
 
 
5517 aa  62.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2043  hypothetical protein  33.5 
 
 
2604 aa  62.4  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0241437 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  28.69 
 
 
1757 aa  61.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4196  conserved repeat domain protein  31.47 
 
 
666 aa  61.2  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00838745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3822  Cna B domain protein  42.22 
 
 
1243 aa  60.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  28.4 
 
 
1989 aa  60.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  28.85 
 
 
2656 aa  57.4  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  28.57 
 
 
1118 aa  57.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  30.05 
 
 
2990 aa  57  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  34.11 
 
 
587 aa  56.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  31.1 
 
 
5544 aa  54.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  31.79 
 
 
440 aa  54.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2872  hypothetical protein  44 
 
 
876 aa  53.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0292  Cna B domain protein  29.13 
 
 
2112 aa  53.5  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0825  Cna B domain protein  32.11 
 
 
733 aa  53.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0290011 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0207  sdrG protein  27.52 
 
 
892 aa  52.8  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  27.59 
 
 
3324 aa  52.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2435  hypothetical protein  28.35 
 
 
689 aa  50.8  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0023  hypothetical protein  24.63 
 
 
2233 aa  50.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  43.75 
 
 
8918 aa  50.4  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4292  Cna B domain-containing protein  27.69 
 
 
2890 aa  50.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.339674 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4941  hypothetical protein  27.56 
 
 
845 aa  48.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0859388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2567  hypothetical protein  38 
 
 
1020 aa  48.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  31.78 
 
 
2876 aa  48.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0471  hypothetical protein  27.52 
 
 
1059 aa  48.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.128084  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2703  Cna B domain protein  30.77 
 
 
586 aa  47.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000547211  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3498  Cna B-type  35.35 
 
 
1531 aa  48.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149942  normal  0.725774 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1282  Cna B domain-containing protein  35.53 
 
 
248 aa  47  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.204415  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  27.32 
 
 
909 aa  47.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3592  hypothetical protein  40.26 
 
 
1727 aa  46.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5378  WD40 domain protein beta Propeller  27.04 
 
 
1066 aa  46.6  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1738  conserved repeat domain protein  32.29 
 
 
1519 aa  45.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  29.81 
 
 
898 aa  45.8  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3048  Cna B-type  28.78 
 
 
733 aa  45.8  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.938472  normal  0.0115625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6958  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  42.42 
 
 
371 aa  45.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13653  hypothetical protein  40 
 
 
1665 aa  45.4  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>