79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0310 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  100 
 
 
924 aa  1818    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  38.13 
 
 
898 aa  445  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  36 
 
 
909 aa  395  1e-108  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  29.33 
 
 
2000 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0752  conserved repeat domain-containing protein  32.5 
 
 
897 aa  113  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.389587  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  29 
 
 
1984 aa  107  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  31.23 
 
 
3486 aa  97.4  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  31.75 
 
 
3634 aa  87.8  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  31.75 
 
 
2078 aa  87  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2435  hypothetical protein  34.22 
 
 
689 aa  84.3  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  33.86 
 
 
2853 aa  80.9  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2432  hypothetical protein  26.4 
 
 
722 aa  77  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.160714  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  25.75 
 
 
5017 aa  75.5  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  31.4 
 
 
1809 aa  74.7  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  30.92 
 
 
2490 aa  73.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  25.56 
 
 
5017 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  23.59 
 
 
2520 aa  72.4  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  25.19 
 
 
5017 aa  72  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  31.15 
 
 
2358 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  31.15 
 
 
2358 aa  71.6  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  31.4 
 
 
2490 aa  71.2  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  25.99 
 
 
2121 aa  71.2  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  26.55 
 
 
5010 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  25.29 
 
 
2113 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  23.67 
 
 
1533 aa  70.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  27.96 
 
 
1580 aa  70.1  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  32.05 
 
 
2490 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  31.4 
 
 
2490 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  33.2 
 
 
2490 aa  69.3  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  31.94 
 
 
2886 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  24.41 
 
 
1857 aa  68.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  32.67 
 
 
2490 aa  67.8  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  25.19 
 
 
5017 aa  67.4  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  24.3 
 
 
2520 aa  67.4  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  25.19 
 
 
5017 aa  67.4  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5332  cell wall anchor domain-containing protein  24.49 
 
 
975 aa  67  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  31.9 
 
 
2485 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5389  surface protein, lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  24.49 
 
 
939 aa  65.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  31.63 
 
 
2487 aa  63.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  26.63 
 
 
5010 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  30.24 
 
 
2118 aa  62.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  23.7 
 
 
2489 aa  61.6  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  28.57 
 
 
2418 aa  61.6  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  28.29 
 
 
2434 aa  60.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2285  conserved repeat domain protein  28.66 
 
 
1168 aa  60.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.22424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  31.36 
 
 
2573 aa  58.9  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  25.15 
 
 
5010 aa  58.9  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  32.03 
 
 
1989 aa  58.9  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  26.06 
 
 
5010 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  24.24 
 
 
1441 aa  58.5  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0147  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  38.1 
 
 
2724 aa  56.2  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0765  hypothetical protein  29.3 
 
 
1624 aa  55.8  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0595107  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  27.64 
 
 
3602 aa  55.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0854  conserved repeat domain protein  32.54 
 
 
1150 aa  55.1  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.31154  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4949  hypothetical protein  25.96 
 
 
509 aa  55.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.780389  normal  0.562948 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1880  conserved repeat domain protein  30.51 
 
 
440 aa  54.7  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.152286  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  25.05 
 
 
983 aa  53.9  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1328  hypothetical protein  26.73 
 
 
1702 aa  53.9  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.191711 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0148  conserved repeat domain protein  31.22 
 
 
2553 aa  53.5  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  26.09 
 
 
1946 aa  53.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2181  conserved repeat domain protein  21.67 
 
 
599 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.609194 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  25.79 
 
 
1129 aa  52  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  27.7 
 
 
5517 aa  50.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1046  hypothetical protein  23.05 
 
 
1757 aa  51.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.273403  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3693  hypothetical protein  26.5 
 
 
429 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  30.68 
 
 
4896 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  24.11 
 
 
1898 aa  50.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  28.83 
 
 
5166 aa  50.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  38.89 
 
 
5544 aa  49.3  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  39 
 
 
2713 aa  49.3  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3593  hypothetical protein  37.78 
 
 
695 aa  48.5  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  26.11 
 
 
1537 aa  48.5  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24760  conserved repeat protein  38.55 
 
 
1516 aa  48.1  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.216781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  33.14 
 
 
3911 aa  47  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1176  hypothetical protein  30.86 
 
 
1202 aa  47  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3776  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.41 
 
 
554 aa  45.8  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000930307  unclonable  0.00000981253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  28.63 
 
 
1332 aa  45.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  29.82 
 
 
3324 aa  45.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1806  hypothetical protein  32.91 
 
 
621 aa  44.7  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>