45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0529 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 3209 aa  6044    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  36.45 
 
 		 4672 aa  211  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  33.37 
 
 		 2795 aa  209  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  31.13 
 
 		 1976 aa  169  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  26.31 
 
 		 1417 aa  112  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  26.33 
 
 		 1417 aa  110  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  26.41 
 
 		 1418 aa  99.8  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5942  conserved repeat domain protein  41.29 
 
 		 2412 aa  96.7  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5514  hypothetical protein  36.6 
 
 		 1504 aa  87  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  37.4 
 
 		 1394 aa  79.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  28.2 
 
 		 2933 aa  78.6  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  25.94 
 
 		 2573 aa  77  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  26.86 
 
 		 1396 aa  75.9  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  26.28 
 
 		 2933 aa  73.6  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  25.63 
 
 		 2358 aa  72.4  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  25.63 
 
 		 2367 aa  72.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  25.63 
 
 		 2383 aa  72.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  26.96 
 
 		 4896 aa  70.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0772  fibronectin type III domain-containing protein  43 
 
 		 497 aa  70.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  25 
 
 		 2296 aa  68.6  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  24.66 
 
 		 2358 aa  67.8  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07115  hypothetical protein  27.74 
 
 		 1164 aa  67.8  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  26.71 
 
 		 5337 aa  67  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  25.03 
 
 		 2620 aa  66.6  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  32.08 
 
 		 4953 aa  65.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  30.92 
 
 		 1532 aa  64.7  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.36 
 
 		 1284 aa  63.2  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  25.51 
 
 		 1537 aa  62  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  28.44 
 
 		 1332 aa  62  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  25.34 
 
 		 3634 aa  60.5  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4710  ubiquitin  37.61 
 
 		 287 aa  58.2  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  24.29 
 
 		 1746 aa  56.2  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  26.65 
 
 		 1417 aa  55.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  27.02 
 
 		 1075 aa  54.7  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  26.4 
 
 		 1075 aa  53.1  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  26.4 
 
 		 1050 aa  52.4  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4114  hypothetical protein  54.39 
 
 		 747 aa  50.8  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  33.11 
 
 		 690 aa  48.9  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  31.76 
 
 		 941 aa  48.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  31.76 
 
 		 969 aa  48.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07116  hypothetical protein  28 
 
 		 330 aa  47.4  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  35.98 
 
 		 3739 aa  47.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2835  VCBS repeat-containing protein  35.98 
 
 		 3824 aa  47  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  35.98 
 
 		 3824 aa  47  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2903  large repetitive protein  35.98 
 
 		 3721 aa  47  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>