34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4710 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4710  ubiquitin  100 
 
 		 287 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_56440  predicted protein  51.08 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143287  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49037  predicted protein  80.82 
 
 		 205 aa  130  4.0000000000000003e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.227724  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22043  ubiquitin extension protein 1/2  80.82 
 
 		 128 aa  128  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02000  Polyubiquitin Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A2RVC1]  49.64 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505537  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02620  ATP-dependent protein binding protein, putative  78.38 
 
 		 457 aa  126  3e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.675175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3361  ubiquitin  62.63 
 
 		 360 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal  0.0422068 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03330  ubiquitin-carboxy extension protein fusion, putative  78.08 
 
 		 129 aa  125  7e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.507296  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73878  predicted protein  48.92 
 
 		 305 aa  125  7e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32483  Ribosomal protein S27a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  78.08 
 
 		 150 aa  125  8.000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079306  decreased coverage  0.00789821 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26775  predicted protein  78.08 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.246386 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27118  ubiquitin extension protein 3  80 
 
 		 155 aa  123  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73842  Ubiquitin/40S ribosomal protein S27a fusion  77.14 
 
 		 151 aa  120  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04872  Putative uncharacterized proteinUBI1 ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV58]  77.14 
 
 		 154 aa  119  7.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.171083 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16428  Ribosomal protein L40, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  72.6 
 
 		 128 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.328088  normal  0.0552744 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  38.8 
 
 		 3209 aa  94.7  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40601  predicted protein  49.28 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.684929  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54323  ubiquitin-like protein  55.42 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03060  ribosomal chaperone, putative  49.32 
 
 		 159 aa  78.6  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.473812  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06179  hypothetical protein similar to SPBC24C6.01c (Broad)  43.84 
 
 		 81 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.92156 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5514  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1504 aa  68.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34540  predicted protein  43.84 
 
 		 77 aa  67.8  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85034  predicted protein  35.92 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.737973  normal  0.53722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5889  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  36.55 
 
 		 859 aa  59.7  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.622586 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02170  conserved hypothetical protein  40 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01010  conserved hypothetical protein  41.38 
 
 		 396 aa  55.8  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252754  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04440  ribosomal chaperone, putative  47.06 
 
 		 88 aa  55.5  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0863999  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4990  Ig domain-containing protein  38.71 
 
 		 1532 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05451  ubiquitin-like protein DskB, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13420)  38.24 
 
 		 440 aa  50.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.94 
 
 		 1284 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  31.65 
 
 		 1394 aa  49.7  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07500  uv excision repair protein rhp23, putative  31.51 
 
 		 406 aa  47.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.40464  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0772  fibronectin type III domain-containing protein  32.71 
 
 		 497 aa  46.6  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02304  UV excision repair protein (RadW), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06040)  35.38 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0290745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>