79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2821 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  72.17 
 
 
2367 aa  2516    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  72.17 
 
 
2383 aa  2516    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  72.07 
 
 
2358 aa  2512    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  100 
 
 
2620 aa  5292    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  72.16 
 
 
2296 aa  2516    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  52.49 
 
 
1746 aa  1306    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  40.38 
 
 
2933 aa  1297    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  72.38 
 
 
2358 aa  2528    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  33.62 
 
 
1417 aa  582  1e-164  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  33.61 
 
 
1417 aa  579  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  33.74 
 
 
1396 aa  573  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  28.92 
 
 
2795 aa  570  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  33.7 
 
 
1418 aa  561  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  30.3 
 
 
1976 aa  522  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  45.04 
 
 
1417 aa  473  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  41.35 
 
 
5337 aa  431  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  41.35 
 
 
4953 aa  430  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  41.58 
 
 
2933 aa  422  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  33.25 
 
 
1050 aa  396  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  33.25 
 
 
1075 aa  395  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  33.14 
 
 
1075 aa  394  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  43.89 
 
 
1084 aa  374  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  54.94 
 
 
410 aa  323  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  39.86 
 
 
969 aa  318  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  39.86 
 
 
941 aa  318  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  39.9 
 
 
934 aa  298  1e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  55.51 
 
 
295 aa  291  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  55.51 
 
 
292 aa  291  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  38.46 
 
 
730 aa  268  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  37.74 
 
 
730 aa  260  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  37.74 
 
 
730 aa  261  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  37.74 
 
 
730 aa  260  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  34.89 
 
 
724 aa  252  7e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.440388 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  37.5 
 
 
730 aa  251  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  32.65 
 
 
468 aa  185  9.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  30.54 
 
 
497 aa  180  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  29.48 
 
 
474 aa  164  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  29.48 
 
 
509 aa  164  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  29.48 
 
 
474 aa  163  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  29.48 
 
 
474 aa  162  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  31.86 
 
 
464 aa  161  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  31.86 
 
 
476 aa  160  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  30.39 
 
 
474 aa  160  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.125708 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  31.86 
 
 
464 aa  160  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  31.86 
 
 
476 aa  159  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  31.86 
 
 
464 aa  159  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  37 
 
 
660 aa  159  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  36.63 
 
 
660 aa  158  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  31.86 
 
 
464 aa  158  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.10975 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  32.28 
 
 
417 aa  158  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  32.28 
 
 
417 aa  158  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  35.79 
 
 
660 aa  157  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  35.79 
 
 
660 aa  157  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  36.26 
 
 
660 aa  157  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  31.58 
 
 
464 aa  155  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  36.07 
 
 
690 aa  135  9e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  32.8 
 
 
1459 aa  114  2.0000000000000002e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  26.36 
 
 
4672 aa  94.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  33 
 
 
543 aa  93.2  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  25.21 
 
 
845 aa  75.1  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  32.65 
 
 
811 aa  61.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  25.42 
 
 
3209 aa  61.2  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0821  Ig domain-containing protein  29.49 
 
 
609 aa  60.5  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0946552  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  34.38 
 
 
1005 aa  59.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  26.39 
 
 
727 aa  58.9  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  27.12 
 
 
614 aa  56.6  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05990  hypothetical protein  30.11 
 
 
857 aa  55.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05976  hypothetical protein  30.12 
 
 
850 aa  54.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1179  adhesin-like protein  37.37 
 
 
372 aa  53.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00551453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0559  hypothetical protein  32.71 
 
 
302 aa  53.1  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0270722  normal  0.124487 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0328  Ig domain-containing protein  27.01 
 
 
830 aa  52.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.979457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2924  Ig-like, group 1  36.52 
 
 
633 aa  50.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2415  hypothetical protein  27.81 
 
 
507 aa  51.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5514  hypothetical protein  27.62 
 
 
1504 aa  50.8  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  24.5 
 
 
1361 aa  50.1  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0979  Ig domain-containing protein  28.09 
 
 
1630 aa  49.3  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0609358  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  26.78 
 
 
821 aa  47  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4857  hypothetical protein  25.32 
 
 
1112 aa  47  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1934  intimin/invasin family protein  28.47 
 
 
294 aa  46.2  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>