48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0559 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0559  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  632  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0270722  normal  0.124487 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  27.38 
 
 
724 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.440388 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  31.86 
 
 
1459 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  30.28 
 
 
730 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  30.28 
 
 
730 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  30.28 
 
 
730 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  30.28 
 
 
730 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  30.28 
 
 
730 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  28.95 
 
 
292 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  28.95 
 
 
410 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  28.07 
 
 
295 aa  55.8  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  28.07 
 
 
1417 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  28.07 
 
 
1417 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  28.95 
 
 
1396 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  28.95 
 
 
1418 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  28.07 
 
 
1417 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  32.71 
 
 
2367 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  32.71 
 
 
2383 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  32.71 
 
 
2358 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  32.71 
 
 
2296 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  30.51 
 
 
1084 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  32.71 
 
 
2620 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  31.37 
 
 
1075 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  31.37 
 
 
1075 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  31.37 
 
 
1050 aa  52.4  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  31.93 
 
 
1976 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  33.72 
 
 
543 aa  50.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  31.93 
 
 
2795 aa  50.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  31.78 
 
 
2358 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1179  adhesin-like protein  29.25 
 
 
372 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00551453  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  27.59 
 
 
941 aa  47.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  28.85 
 
 
1746 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  25.84 
 
 
660 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  25.2 
 
 
2933 aa  46.2  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  27.59 
 
 
969 aa  45.8  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  27.16 
 
 
509 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  25.84 
 
 
660 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  27.16 
 
 
474 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  25.36 
 
 
660 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  27.96 
 
 
5337 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  30.43 
 
 
474 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.125708 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  27.96 
 
 
4953 aa  45.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  30.43 
 
 
474 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  27.16 
 
 
474 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  26.4 
 
 
660 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  25.89 
 
 
660 aa  43.5  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  32.39 
 
 
468 aa  42.7  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  23.81 
 
 
934 aa  42.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>