52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1320 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  51.78 
 
 		 817 aa  737    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  60.21 
 
 		 837 aa  884    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  55.36 
 
 		 676 aa  676    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  53.89 
 
 		 807 aa  791    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  61.14 
 
 		 818 aa  926    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  59.5 
 
 		 838 aa  884    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  57.74 
 
 		 851 aa  842    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  52.78 
 
 		 819 aa  736    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  61.58 
 
 		 835 aa  910    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  100 
 
 		 821 aa  1612    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  59.06 
 
 		 820 aa  885    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  42.25 
 
 		 878 aa  527  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  35.42 
 
 		 1209 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  35.42 
 
 		 1209 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  33.22 
 
 		 1237 aa  357  5e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  32.84 
 
 		 1224 aa  346  8e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  35.78 
 
 		 811 aa  346  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  32.84 
 
 		 1224 aa  346  1e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  32.65 
 
 		 1224 aa  340  4e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  36.62 
 
 		 638 aa  290  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  33.62 
 
 		 837 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  33.84 
 
 		 840 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  32.5 
 
 		 826 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  34.04 
 
 		 836 aa  271  4e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  32.15 
 
 		 843 aa  265  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  37.34 
 
 		 834 aa  266  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  33.12 
 
 		 826 aa  264  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  34.19 
 
 		 829 aa  263  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  33.65 
 
 		 836 aa  263  1e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  34.06 
 
 		 829 aa  261  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  33.79 
 
 		 829 aa  258  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  32.6 
 
 		 851 aa  253  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  33.9 
 
 		 830 aa  244  3e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  34.46 
 
 		 651 aa  243  1e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  30.95 
 
 		 851 aa  227  7e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  36.25 
 
 		 476 aa  192  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  32.79 
 
 		 638 aa  131  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  33.63 
 
 		 366 aa  128  6e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  34.82 
 
 		 498 aa  98.6  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  25.95 
 
 		 845 aa  90.1  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  38.93 
 
 		 727 aa  74.3  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  28.38 
 
 		 2795 aa  59.3  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0127  von Willebrand factor, type A  24.94 
 
 		 1081 aa  55.8  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  26.09 
 
 		 1746 aa  52.8  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  27.3 
 
 		 2620 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  25.88 
 
 		 1976 aa  48.9  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3697  LigA  32.97 
 
 		 951 aa  48.5  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0503311  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0821  Ig domain-containing protein  26.94 
 
 		 609 aa  48.5  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0946552  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  29.82 
 
 		 614 aa  48.1  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3639  LigA  32.26 
 
 		 948 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  27.22 
 
 		 1084 aa  45.4  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2924  Ig-like, group 1  36.78 
 
 		 633 aa  44.7  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>