34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1001 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  100 
 
 
614 aa  1182    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2924  Ig-like, group 1  43.81 
 
 
633 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  34.08 
 
 
727 aa  253  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  32.49 
 
 
845 aa  244  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0821  Ig domain-containing protein  32.31 
 
 
609 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0946552  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2760  Ig domain-containing protein  30 
 
 
670 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1988  Ig-like, group 1  29.29 
 
 
667 aa  161  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5576  hypothetical protein  30.74 
 
 
535 aa  111  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.101145  normal  0.740819 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3402  hypothetical protein  29.3 
 
 
562 aa  103  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.677203 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0328  Ig domain-containing protein  31.79 
 
 
830 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.979457  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  32.24 
 
 
1084 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  28.99 
 
 
2358 aa  60.5  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  26.8 
 
 
2296 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  26.67 
 
 
2383 aa  58.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  26.67 
 
 
2367 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  26.67 
 
 
2358 aa  58.5  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  31.56 
 
 
4953 aa  58.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  30.08 
 
 
1050 aa  57.8  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  26.06 
 
 
1746 aa  57.4  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  30.08 
 
 
1075 aa  57.4  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  29.91 
 
 
2795 aa  56.2  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  29.2 
 
 
1976 aa  55.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  30.08 
 
 
1075 aa  55.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  27.17 
 
 
2620 aa  53.9  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  32.78 
 
 
5337 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  30.43 
 
 
2933 aa  51.2  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  31.43 
 
 
638 aa  48.5  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0553  von Willebrand factor, type A  24.69 
 
 
1002 aa  47.8  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253544  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  30.31 
 
 
821 aa  47.4  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  27.42 
 
 
851 aa  45.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  25.99 
 
 
836 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  32.89 
 
 
934 aa  45.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  27.17 
 
 
2933 aa  43.9  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  28.57 
 
 
837 aa  44.3  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>