59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_00260 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 1418 aa  635    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  99.32 
 
 		 1417 aa  632  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  98.63 
 
 		 1417 aa  629  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  98.97 
 
 		 1417 aa  628  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  100 
 
 		 410 aa  616  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  613  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  99.66 
 
 		 295 aa  613  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  99.63 
 
 		 1396 aa  585  1e-166  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  59.56 
 
 		 2933 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  55.51 
 
 		 2620 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  55.51 
 
 		 2296 aa  290  3e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  54.35 
 
 		 2383 aa  288  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  54.35 
 
 		 2367 aa  288  6e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  54.35 
 
 		 2358 aa  288  6e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  53.25 
 
 		 1746 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  54.63 
 
 		 2358 aa  285  7e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  45.14 
 
 		 1050 aa  268  7e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  44.79 
 
 		 1075 aa  267  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  44.79 
 
 		 1075 aa  267  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  54.02 
 
 		 1084 aa  259  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  54.21 
 
 		 4953 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  54.21 
 
 		 5337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  52.65 
 
 		 2933 aa  253  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  50 
 
 		 1976 aa  242  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  49.57 
 
 		 2795 aa  241  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  54.12 
 
 		 969 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  54.12 
 
 		 941 aa  227  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  43.58 
 
 		 934 aa  207  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  49 
 
 		 730 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  48 
 
 		 730 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  48 
 
 		 730 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  48 
 
 		 730 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  46 
 
 		 724 aa  192  7e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.440388 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  48 
 
 		 730 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  37.07 
 
 		 497 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  33.76 
 
 		 660 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  33.76 
 
 		 660 aa  140  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  33.76 
 
 		 660 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  32.91 
 
 		 660 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  33.33 
 
 		 660 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  35.1 
 
 		 468 aa  123  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  33.33 
 
 		 474 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  35.42 
 
 		 464 aa  120  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  35.42 
 
 		 464 aa  120  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  35.42 
 
 		 476 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  35.42 
 
 		 476 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  35.42 
 
 		 464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10975 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  33.33 
 
 		 474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  33.33 
 
 		 509 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  35.42 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  35.42 
 
 		 417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  32.9 
 
 		 474 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.125708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  32.9 
 
 		 474 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  34.9 
 
 		 464 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  34.38 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  32.68 
 
 		 1459 aa  107  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  37.78 
 
 		 543 aa  86.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1179  adhesin-like protein  32.35 
 
 		 372 aa  57.4  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00551453  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0559  hypothetical protein  28.95 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0270722  normal  0.124487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>