65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2711 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  100 
 
 		 730 aa  1513    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  99.45 
 
 		 730 aa  1506    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  96.58 
 
 		 730 aa  1472    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  98.9 
 
 		 730 aa  1498    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  74.28 
 
 		 724 aa  1150    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.440388 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  99.45 
 
 		 730 aa  1507    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  47.87 
 
 		 4953 aa  294  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  47.87 
 
 		 5337 aa  294  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  38.66 
 
 		 2933 aa  293  9e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  35.43 
 
 		 1976 aa  291  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  37.53 
 
 		 2795 aa  291  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  45.22 
 
 		 2933 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  37.31 
 
 		 1417 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  41.69 
 
 		 1417 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  41.69 
 
 		 1396 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  41.69 
 
 		 1418 aa  271  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  41.39 
 
 		 1417 aa  269  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  37.92 
 
 		 1084 aa  265  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  35.96 
 
 		 2367 aa  261  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  37.02 
 
 		 2358 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  35.96 
 
 		 2383 aa  261  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  34.46 
 
 		 934 aa  260  6e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  36.4 
 
 		 2358 aa  259  9e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  35.2 
 
 		 1075 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  35.97 
 
 		 969 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  35.2 
 
 		 1075 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  37.5 
 
 		 2620 aa  258  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  34.97 
 
 		 1050 aa  257  5e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  35.73 
 
 		 941 aa  257  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  36.78 
 
 		 2296 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  34.84 
 
 		 497 aa  253  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  41.77 
 
 		 1746 aa  248  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  32.67 
 
 		 468 aa  229  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  32.36 
 
 		 464 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  45.57 
 
 		 410 aa  213  9e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  32.15 
 
 		 464 aa  213  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  32.15 
 
 		 476 aa  212  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  32.15 
 
 		 476 aa  212  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  32.15 
 
 		 464 aa  212  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  32.15 
 
 		 464 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10975 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  32.24 
 
 		 509 aa  208  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  31.94 
 
 		 464 aa  208  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  32.67 
 
 		 474 aa  207  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  32.81 
 
 		 474 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  32.24 
 
 		 474 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  32.45 
 
 		 474 aa  203  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.125708 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  32.48 
 
 		 417 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  32.48 
 
 		 417 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  48 
 
 		 295 aa  198  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  48 
 
 		 292 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  32.52 
 
 		 660 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  32.29 
 
 		 660 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  32.29 
 
 		 660 aa  190  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  32.29 
 
 		 660 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  31.63 
 
 		 660 aa  187  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  31.42 
 
 		 1459 aa  153  1e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  27.99 
 
 		 543 aa  108  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  29.17 
 
 		 690 aa  105  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2710  hypothetical protein  35.16 
 
 		 320 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2753  hypothetical protein  36 
 
 		 321 aa  71.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0353095 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2884  putative outer membrane protein  35.48 
 
 		 319 aa  70.5  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2773  hypothetical protein  35.16 
 
 		 320 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1179  adhesin-like protein  35.26 
 
 		 372 aa  63.9  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00551453  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2667  hypothetical protein  34.4 
 
 		 323 aa  63.9  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0559  hypothetical protein  30.28 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0270722  normal  0.124487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>