14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2884 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2884  putative outer membrane protein  100 
 
 		 319 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2753  hypothetical protein  90.97 
 
 		 321 aa  589  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0353095 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2773  hypothetical protein  89.1 
 
 		 320 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2667  hypothetical protein  89.16 
 
 		 323 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2710  hypothetical protein  87.54 
 
 		 320 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2660  putative adhesin  42.56 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.468628 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  35.48 
 
 		 730 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  35.48 
 
 		 730 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  35.48 
 
 		 730 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  35.48 
 
 		 730 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  34.68 
 
 		 730 aa  70.1  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  35.4 
 
 		 724 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.440388 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0691  hypothetical protein  33.93 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0759  hypothetical protein  33.93 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.415952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>