68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2429 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  98.83 
 
 		 690 aa  1373    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  99.89 
 
 		 941 aa  1927    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  100 
 
 		 969 aa  1992    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  39.64 
 
 		 2795 aa  487  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  39.31 
 
 		 1976 aa  486  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  45.57 
 
 		 5337 aa  475  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  45.57 
 
 		 4953 aa  475  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  43.01 
 
 		 2933 aa  471  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  38.36 
 
 		 1084 aa  386  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  36.89 
 
 		 1417 aa  382  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  37.26 
 
 		 1418 aa  379  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  37.26 
 
 		 1417 aa  378  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  37.26 
 
 		 1417 aa  379  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  37.26 
 
 		 1396 aa  379  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  35.75 
 
 		 1075 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  39.71 
 
 		 2933 aa  348  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  35.75 
 
 		 1050 aa  348  2e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  35.75 
 
 		 1075 aa  348  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  37.18 
 
 		 934 aa  337  9e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  35.74 
 
 		 1746 aa  323  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  40.32 
 
 		 2367 aa  323  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  40.32 
 
 		 2383 aa  323  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  40.32 
 
 		 2358 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  40.32 
 
 		 2296 aa  320  7e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  39.86 
 
 		 2620 aa  317  5e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  39.86 
 
 		 2358 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  33.33 
 
 		 730 aa  266  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  34.3 
 
 		 724 aa  265  4e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.440388 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  35.97 
 
 		 730 aa  260  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  35.97 
 
 		 730 aa  260  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  35.97 
 
 		 730 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  52.04 
 
 		 410 aa  251  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  36.2 
 
 		 730 aa  250  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  54.12 
 
 		 295 aa  227  8e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  54.12 
 
 		 292 aa  227  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  32.58 
 
 		 468 aa  214  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  32.34 
 
 		 474 aa  208  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  31.84 
 
 		 509 aa  205  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  31.84 
 
 		 474 aa  205  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  31.84 
 
 		 474 aa  204  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  31.34 
 
 		 474 aa  201  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.125708 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  30.2 
 
 		 497 aa  200  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  32.41 
 
 		 464 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  32.41 
 
 		 476 aa  198  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  30.06 
 
 		 464 aa  198  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  32.41 
 
 		 476 aa  198  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  32.41 
 
 		 464 aa  198  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  32.41 
 
 		 417 aa  197  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  32.41 
 
 		 417 aa  197  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  32.41 
 
 		 464 aa  197  7e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  32.41 
 
 		 464 aa  196  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  30.72 
 
 		 660 aa  191  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  30.33 
 
 		 660 aa  191  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  30.45 
 
 		 660 aa  190  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  29.94 
 
 		 660 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  30.2 
 
 		 660 aa  189  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  30.53 
 
 		 1459 aa  110  9.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  24.64 
 
 		 543 aa  94.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  34.57 
 
 		 4672 aa  92  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07115  hypothetical protein  30.11 
 
 		 1164 aa  67.4  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0622  Ig domain-containing protein  38.64 
 
 		 974 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.152382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0595  Ig domain-containing protein  38.64 
 
 		 974 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  31.76 
 
 		 3209 aa  48.5  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0618  Ig domain protein group 1 domain protein  33.71 
 
 		 980 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0627  Ig domain protein group 1 domain protein  33.71 
 
 		 979 aa  47.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0614  Ig domain-containing protein  33.71 
 
 		 980 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0559  hypothetical protein  27.59 
 
 		 302 aa  45.8  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0270722  normal  0.124487 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0587  Ig domain-containing protein  33.71 
 
 		 980 aa  45.4  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>