35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0627 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_0587  Ig domain-containing protein  94.2 
 
 
980 aa  1879    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0627  Ig domain protein group 1 domain protein  100 
 
 
979 aa  2011    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0618  Ig domain protein group 1 domain protein  96.03 
 
 
980 aa  1914    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0622  Ig domain-containing protein  90.22 
 
 
974 aa  1771    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.152382 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0614  Ig domain-containing protein  93.89 
 
 
980 aa  1853    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0595  Ig domain-containing protein  90.22 
 
 
974 aa  1771    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0591  hypothetical protein  32.3 
 
 
1010 aa  438  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0615  Ig domain-containing protein  28.92 
 
 
968 aa  295  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0498521  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0619  Ig domain protein group 1 domain protein  28.92 
 
 
968 aa  295  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0588  Ig domain-containing protein  29.04 
 
 
968 aa  294  6e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  61.36 
 
 
1316 aa  195  4e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0628  hypothetical protein  53.85 
 
 
216 aa  92.4  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0600  hypothetical protein  53.85 
 
 
216 aa  92.4  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01641  hypothetical protein  25.14 
 
 
896 aa  90.1  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05976  hypothetical protein  31.12 
 
 
850 aa  80.1  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05990  hypothetical protein  27.89 
 
 
857 aa  70.1  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  41.38 
 
 
2933 aa  64.7  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  38.89 
 
 
1075 aa  63.9  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  38.89 
 
 
1050 aa  63.9  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  37.08 
 
 
4953 aa  64.3  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  38.89 
 
 
1075 aa  63.9  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05832  peptidase  27.15 
 
 
847 aa  62.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  38.2 
 
 
5337 aa  62  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2711  hypothetical protein  28.03 
 
 
965 aa  57.8  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  37.04 
 
 
2933 aa  57  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  40.91 
 
 
1417 aa  55.1  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  39.77 
 
 
1418 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  39.77 
 
 
1417 aa  51.6  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04723  hypothetical protein  37.21 
 
 
148 aa  50.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  38.64 
 
 
1417 aa  48.5  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  33.71 
 
 
941 aa  47.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  33.71 
 
 
969 aa  47.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  34.52 
 
 
1084 aa  46.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  37.5 
 
 
1396 aa  45.1  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  32.58 
 
 
690 aa  44.7  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>