34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05976 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05990  hypothetical protein  88.09 
 
 
857 aa  1482    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05976  hypothetical protein  100 
 
 
850 aa  1743    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05832  peptidase  89.72 
 
 
847 aa  1502    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01641  hypothetical protein  32.42 
 
 
896 aa  283  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04723  hypothetical protein  59.73 
 
 
148 aa  169  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3534  hypothetical protein  40.1 
 
 
244 aa  125  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3364  hypothetical protein  39.58 
 
 
244 aa  122  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0589  hypothetical protein  45.32 
 
 
244 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0622  Ig domain-containing protein  29.55 
 
 
974 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.152382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0595  Ig domain-containing protein  29.55 
 
 
974 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0614  Ig domain-containing protein  28.67 
 
 
980 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0627  Ig domain protein group 1 domain protein  31.12 
 
 
979 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0587  Ig domain-containing protein  28.32 
 
 
980 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0618  Ig domain protein group 1 domain protein  28.42 
 
 
980 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2711  hypothetical protein  25.89 
 
 
965 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0591  hypothetical protein  28.62 
 
 
1010 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0588  Ig domain-containing protein  24.03 
 
 
968 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0615  Ig domain-containing protein  24.03 
 
 
968 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0498521  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0619  Ig domain protein group 1 domain protein  24.03 
 
 
968 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  29.47 
 
 
1316 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  30.12 
 
 
2620 aa  55.1  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  29.52 
 
 
2383 aa  54.7  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  29.52 
 
 
2367 aa  54.3  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  29.52 
 
 
2358 aa  54.3  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  30.07 
 
 
2296 aa  53.5  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  29.41 
 
 
2358 aa  51.2  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  29.21 
 
 
1417 aa  49.7  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  35.29 
 
 
1418 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2308  hypothetical protein  22.25 
 
 
962 aa  48.5  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  29.93 
 
 
2933 aa  48.5  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  26.04 
 
 
1410 aa  48.5  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  26.04 
 
 
1410 aa  48.5  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  26.04 
 
 
1408 aa  48.5  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  24.4 
 
 
1422 aa  47.8  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>