35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05990 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05976  hypothetical protein  88.09 
 
 		 850 aa  1506    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05832  peptidase  86.91 
 
 		 847 aa  1457    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05990  hypothetical protein  100 
 
 		 857 aa  1759    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01641  hypothetical protein  31.77 
 
 		 896 aa  283  7.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04723  hypothetical protein  56 
 
 		 148 aa  154  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3534  hypothetical protein  50.37 
 
 		 244 aa  121  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0589  hypothetical protein  42.07 
 
 		 244 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3364  hypothetical protein  49.63 
 
 		 244 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2711  hypothetical protein  26.15 
 
 		 965 aa  84  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0614  Ig domain-containing protein  30.61 
 
 		 980 aa  82  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0587  Ig domain-containing protein  30.27 
 
 		 980 aa  79  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0627  Ig domain protein group 1 domain protein  28.57 
 
 		 979 aa  73.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0622  Ig domain-containing protein  27.61 
 
 		 974 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.152382 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0615  Ig domain-containing protein  24.79 
 
 		 968 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0498521  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0595  Ig domain-containing protein  27.61 
 
 		 974 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0588  Ig domain-containing protein  24.79 
 
 		 968 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0619  Ig domain protein group 1 domain protein  24.79 
 
 		 968 aa  68.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0591  hypothetical protein  25.82 
 
 		 1010 aa  67  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0618  Ig domain protein group 1 domain protein  28.33 
 
 		 980 aa  66.6  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  30.46 
 
 		 2620 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  29.89 
 
 		 2383 aa  58.9  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  29.89 
 
 		 2367 aa  58.9  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  29.89 
 
 		 2358 aa  58.9  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  30.43 
 
 		 2296 aa  57.8  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  28.96 
 
 		 1316 aa  55.1  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  30.07 
 
 		 2358 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  23.75 
 
 		 1422 aa  48.9  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  25.44 
 
 		 1410 aa  48.1  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  25.44 
 
 		 1410 aa  48.1  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  25.44 
 
 		 1408 aa  47.8  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2308  hypothetical protein  21.41 
 
 		 962 aa  47  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0419846 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  36.13 
 
 		 1746 aa  45.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  33.61 
 
 		 1418 aa  44.7  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  25.45 
 
 		 2933 aa  44.7  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  27.47 
 
 		 1417 aa  44.3  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>