26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0588 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_0591  hypothetical protein  81.81 
 
 
1010 aa  1391    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0619  Ig domain protein group 1 domain protein  99.79 
 
 
968 aa  1987    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0615  Ig domain-containing protein  99.9 
 
 
968 aa  1989    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0498521  normal  0.318531 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0588  Ig domain-containing protein  100 
 
 
968 aa  1990    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0618  Ig domain protein group 1 domain protein  29.04 
 
 
980 aa  294  5e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0627  Ig domain protein group 1 domain protein  29.04 
 
 
979 aa  294  6e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0587  Ig domain-containing protein  28.91 
 
 
980 aa  293  1e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0614  Ig domain-containing protein  28.91 
 
 
980 aa  291  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0595  Ig domain-containing protein  28.72 
 
 
974 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0622  Ig domain-containing protein  28.72 
 
 
974 aa  283  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.152382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0600  hypothetical protein  51.13 
 
 
216 aa  125  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0628  hypothetical protein  51.13 
 
 
216 aa  125  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.831123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0599  hypothetical protein  47.32 
 
 
144 aa  100  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0627  hypothetical protein  47.32 
 
 
117 aa  100  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.808625 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01641  hypothetical protein  27.54 
 
 
896 aa  79.3  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05976  hypothetical protein  24.03 
 
 
850 aa  69.7  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05990  hypothetical protein  24.79 
 
 
857 aa  68.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05832  peptidase  24.09 
 
 
847 aa  67  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2711  hypothetical protein  23.56 
 
 
965 aa  66.2  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04723  hypothetical protein  34.09 
 
 
148 aa  48.5  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3534  hypothetical protein  27.45 
 
 
244 aa  48.1  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  31.33 
 
 
5337 aa  46.6  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  31.33 
 
 
4953 aa  46.6  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0589  hypothetical protein  29.57 
 
 
244 aa  47  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3364  hypothetical protein  28.7 
 
 
244 aa  45.8  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  38.36 
 
 
2933 aa  44.7  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.863096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>