80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4024 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  56.14 
 
 		 1746 aa  994    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  41.05 
 
 		 2383 aa  1284    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  40.98 
 
 		 2358 aa  1282    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  100 
 
 		 2933 aa  5907    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  41.02 
 
 		 2358 aa  1274    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  40.98 
 
 		 2367 aa  1284    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  40.82 
 
 		 2296 aa  1209    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  40.38 
 
 		 2620 aa  1280    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  35.4 
 
 		 1417 aa  615  9.999999999999999e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  34.05 
 
 		 1417 aa  612  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  34 
 
 		 1418 aa  612  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  33.87 
 
 		 1417 aa  612  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  34.84 
 
 		 1396 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  28.16 
 
 		 2795 aa  531  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  33.51 
 
 		 1976 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  32.08 
 
 		 4953 aa  459  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  35.25 
 
 		 2933 aa  456  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  39.29 
 
 		 5337 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  32.78 
 
 		 1075 aa  383  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  32.34 
 
 		 1075 aa  383  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  32.47 
 
 		 1050 aa  384  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  34.62 
 
 		 1084 aa  364  1e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  39.71 
 
 		 969 aa  348  7e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  39.71 
 
 		 941 aa  348  1e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  58.57 
 
 		 410 aa  336  4e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  60.36 
 
 		 295 aa  303  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  59.56 
 
 		 292 aa  303  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  35.22 
 
 		 934 aa  289  5.999999999999999e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  46.82 
 
 		 730 aa  281  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  45.54 
 
 		 730 aa  278  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  45.54 
 
 		 730 aa  278  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  45.54 
 
 		 730 aa  278  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  39.75 
 
 		 724 aa  271  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.440388 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  45.22 
 
 		 730 aa  270  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  34.12 
 
 		 468 aa  209  7e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  34.29 
 
 		 497 aa  204  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  31.28 
 
 		 474 aa  181  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  30.97 
 
 		 509 aa  179  9e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  31.04 
 
 		 474 aa  178  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  31.04 
 
 		 474 aa  177  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  31.95 
 
 		 464 aa  176  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  31.95 
 
 		 464 aa  176  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  31.95 
 
 		 476 aa  176  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  31.04 
 
 		 474 aa  175  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.125708 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  31.95 
 
 		 476 aa  175  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  31.95 
 
 		 464 aa  174  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10975 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  31.51 
 
 		 464 aa  174  3e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  32.07 
 
 		 417 aa  173  6e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  32.07 
 
 		 417 aa  173  6e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  31.28 
 
 		 464 aa  170  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  33.14 
 
 		 660 aa  164  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  32.45 
 
 		 660 aa  163  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  32.45 
 
 		 660 aa  163  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  35.23 
 
 		 660 aa  161  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  35.59 
 
 		 660 aa  161  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  38.27 
 
 		 690 aa  160  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  26.25 
 
 		 4672 aa  131  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  26.67 
 
 		 1459 aa  115  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  29.31 
 
 		 543 aa  95.9  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07115  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1164 aa  80.9  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  27.63 
 
 		 2927 aa  79.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  25.35 
 
 		 3486 aa  73.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  26.34 
 
 		 3209 aa  70.1  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0979  Ig domain-containing protein  24.88 
 
 		 1630 aa  69.7  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0609358  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  25.28 
 
 		 1202 aa  63.5  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  25.67 
 
 		 3393 aa  59.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5207  collagen adhesion protein, C-terminal  24.02 
 
 		 882 aa  57.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0614  Ig domain-containing protein  35.34 
 
 		 980 aa  57.4  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0618  Ig domain protein group 1 domain protein  35.4 
 
 		 980 aa  57.4  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0627  Ig domain protein group 1 domain protein  37.04 
 
 		 979 aa  57  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  26.47 
 
 		 3333 aa  55.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0587  Ig domain-containing protein  40.96 
 
 		 980 aa  55.5  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0595  Ig domain-containing protein  41.38 
 
 		 974 aa  54.3  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0622  Ig domain-containing protein  41.38 
 
 		 974 aa  54.3  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.152382 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  22.24 
 
 		 3392 aa  53.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0821  Ig domain-containing protein  29.48 
 
 		 609 aa  51.2  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0946552  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1179  adhesin-like protein  36.71 
 
 		 372 aa  51.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00551453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  27.59 
 
 		 727 aa  48.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05976  hypothetical protein  29.93 
 
 		 850 aa  48.5  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  28.12 
 
 		 3824 aa  46.2  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>