83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4876 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  49.07 
 
 		 2367 aa  1350    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  49.07 
 
 		 2383 aa  1351    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  49.04 
 
 		 2358 aa  1352    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  52.49 
 
 		 2620 aa  1311    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  100 
 
 		 1746 aa  3582    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  56.14 
 
 		 2933 aa  1010    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  49.49 
 
 		 2358 aa  1355    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  49.04 
 
 		 2296 aa  1278    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  31.9 
 
 		 1417 aa  550  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  32.24 
 
 		 1418 aa  545  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  31.37 
 
 		 1417 aa  538  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  31.86 
 
 		 1396 aa  531  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  31.83 
 
 		 1417 aa  526  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  30.65 
 
 		 1976 aa  506  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  29.82 
 
 		 2795 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  30.62 
 
 		 5337 aa  492  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  30.23 
 
 		 2933 aa  480  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  30.91 
 
 		 4953 aa  476  1e-132  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  32.98 
 
 		 1050 aa  424  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  32.98 
 
 		 1075 aa  422  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  32.87 
 
 		 1075 aa  419  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  33.74 
 
 		 1084 aa  388  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  35.74 
 
 		 969 aa  335  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  35.74 
 
 		 941 aa  334  7.000000000000001e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  55.69 
 
 		 410 aa  321  7e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  38.79 
 
 		 934 aa  289  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  53.25 
 
 		 295 aa  287  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  53.25 
 
 		 292 aa  286  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  38.42 
 
 		 730 aa  266  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  36.77 
 
 		 730 aa  256  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  36.77 
 
 		 730 aa  256  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  36.77 
 
 		 730 aa  255  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  35.95 
 
 		 724 aa  250  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.440388 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  36.53 
 
 		 730 aa  246  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  31.87 
 
 		 497 aa  193  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  31.96 
 
 		 468 aa  191  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  33.51 
 
 		 464 aa  182  5.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  33.51 
 
 		 476 aa  181  8e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  33.51 
 
 		 464 aa  181  9e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  33.51 
 
 		 476 aa  181  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  33.24 
 
 		 464 aa  179  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  33.51 
 
 		 417 aa  180  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  33.51 
 
 		 417 aa  180  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  33.51 
 
 		 464 aa  179  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.10975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  29.95 
 
 		 474 aa  179  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  29.72 
 
 		 509 aa  177  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  29.72 
 
 		 474 aa  176  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  29.72 
 
 		 474 aa  176  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  32.97 
 
 		 464 aa  176  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  29.48 
 
 		 474 aa  174  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.125708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  31.18 
 
 		 660 aa  167  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  30.64 
 
 		 660 aa  166  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  30.47 
 
 		 660 aa  166  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  30.47 
 
 		 660 aa  166  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  30.36 
 
 		 660 aa  165  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  31.58 
 
 		 690 aa  142  3.9999999999999997e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  27.76 
 
 		 1459 aa  116  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  30.37 
 
 		 543 aa  94.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  25.19 
 
 		 4672 aa  89.4  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  26.36 
 
 		 727 aa  63.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  29.38 
 
 		 1209 aa  60.1  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2415  hypothetical protein  26.49 
 
 		 507 aa  57.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  26.16 
 
 		 614 aa  56.6  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  25.87 
 
 		 845 aa  56.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1179  adhesin-like protein  38.3 
 
 		 372 aa  55.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00551453  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  28.68 
 
 		 1209 aa  55.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2760  Ig domain-containing protein  26.16 
 
 		 670 aa  55.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07115  hypothetical protein  24.66 
 
 		 1164 aa  53.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  26.57 
 
 		 1224 aa  52.4  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1097  large extracellular alpha-helical protein-like protein  25 
 
 		 1748 aa  51.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000683737 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  25.88 
 
 		 821 aa  50.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4277  Ig domain-containing protein  28.75 
 
 		 690 aa  50.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  26.43 
 
 		 1224 aa  49.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  26.43 
 
 		 1224 aa  49.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0328  Ig domain-containing protein  26.86 
 
 		 830 aa  49.3  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.979457  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  25.96 
 
 		 851 aa  48.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0559  hypothetical protein  28.85 
 
 		 302 aa  47.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0270722  normal  0.124487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  24.29 
 
 		 3209 aa  47  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0622  Ig domain-containing protein  30.18 
 
 		 974 aa  46.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.152382 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0553  von Willebrand factor, type A  26.94 
 
 		 1002 aa  46.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4303  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.19 
 
 		 2122 aa  46.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0595  Ig domain-containing protein  30.18 
 
 		 974 aa  46.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05990  hypothetical protein  36.13 
 
 		 857 aa  45.4  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>