54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2491 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  100 
 
 
1209 aa  2398    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  69.9 
 
 
1237 aa  1699    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  72.73 
 
 
1224 aa  1721    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  99.34 
 
 
1209 aa  2384    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  73.15 
 
 
1224 aa  1735    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  73.24 
 
 
1224 aa  1735    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  35.23 
 
 
821 aa  366  1e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  33.72 
 
 
820 aa  325  4e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  34.63 
 
 
819 aa  324  5e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  33.75 
 
 
835 aa  313  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  33.09 
 
 
818 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  32.76 
 
 
838 aa  297  9e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 
807 aa  296  1e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  31.45 
 
 
851 aa  296  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  32.99 
 
 
817 aa  289  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  34.64 
 
 
676 aa  279  3e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  33.25 
 
 
837 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  31.19 
 
 
878 aa  263  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  34.17 
 
 
638 aa  249  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  28 
 
 
826 aa  218  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  28.46 
 
 
826 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  28.24 
 
 
811 aa  216  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  28.16 
 
 
834 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  27.94 
 
 
836 aa  212  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  28.49 
 
 
837 aa  211  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  27.96 
 
 
836 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  27.31 
 
 
829 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  28.25 
 
 
829 aa  199  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  27.54 
 
 
829 aa  192  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  28.48 
 
 
840 aa  191  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  28.2 
 
 
851 aa  191  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  27.91 
 
 
851 aa  189  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  27.69 
 
 
830 aa  188  6e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  27.31 
 
 
843 aa  188  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  27.01 
 
 
651 aa  155  5e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  29.91 
 
 
476 aa  133  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  36.32 
 
 
845 aa  107  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  28.61 
 
 
366 aa  102  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  28.57 
 
 
638 aa  100  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3697  LigA  28.02 
 
 
951 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0503311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3639  LigA  28.02 
 
 
948 aa  68.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3780  LigA  34.41 
 
 
948 aa  62.8  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155782  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  26.91 
 
 
2795 aa  59.3  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  30.41 
 
 
727 aa  56.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  26.1 
 
 
1976 aa  55.5  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  28.6 
 
 
1746 aa  55.1  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  25.94 
 
 
2358 aa  54.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  31.93 
 
 
498 aa  54.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  25.71 
 
 
2296 aa  53.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  25.18 
 
 
2367 aa  51.6  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  25.18 
 
 
2383 aa  51.6  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  29.23 
 
 
1084 aa  50.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  24.94 
 
 
2358 aa  50.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  30.57 
 
 
1417 aa  45.4  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>