23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3639 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3639  LigA  100 
 
 		 948 aa  1825    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3780  LigA  91.02 
 
 		 948 aa  1472    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155782  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3697  LigA  87.99 
 
 		 951 aa  1399    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0503311  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  50.67 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  28.02 
 
 		 1209 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  28.02 
 
 		 1209 aa  68.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  34.96 
 
 		 638 aa  67  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  30.43 
 
 		 1224 aa  60.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  31.52 
 
 		 1224 aa  58.9  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  31.52 
 
 		 1224 aa  58.9  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  33.61 
 
 		 676 aa  56.6  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  34.04 
 
 		 819 aa  57  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  38.36 
 
 		 638 aa  56.2  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  23.58 
 
 		 1237 aa  52.4  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  31.58 
 
 		 817 aa  50.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  30.56 
 
 		 818 aa  50.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  31.18 
 
 		 807 aa  49.3  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  32.26 
 
 		 821 aa  47.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  26.72 
 
 		 851 aa  47.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  33.33 
 
 		 476 aa  47  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  23.7 
 
 		 826 aa  46.6  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  25.24 
 
 		 826 aa  45.8  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  27.62 
 
 		 820 aa  46.2  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>