44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4101 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  53.62 
 
 		 835 aa  635    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  55.64 
 
 		 820 aa  658    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  55.36 
 
 		 821 aa  666    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  55.44 
 
 		 818 aa  677    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 676 aa  1333    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  50.53 
 
 		 807 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  51.67 
 
 		 817 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  51.49 
 
 		 819 aa  602  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  49.79 
 
 		 838 aa  596  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  49.5 
 
 		 851 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  48.08 
 
 		 837 aa  555  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  40.77 
 
 		 878 aa  427  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  37.5 
 
 		 638 aa  286  7e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  35.61 
 
 		 811 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  34.64 
 
 		 1209 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  34.36 
 
 		 1209 aa  277  5e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  31.65 
 
 		 1237 aa  266  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  31.02 
 
 		 1224 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  31.02 
 
 		 1224 aa  263  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  30.39 
 
 		 1224 aa  261  3e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  34.11 
 
 		 837 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  36.63 
 
 		 651 aa  249  1e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  34.78 
 
 		 840 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  34.56 
 
 		 829 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  33.49 
 
 		 826 aa  239  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  35.62 
 
 		 829 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  34.93 
 
 		 829 aa  234  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  33.66 
 
 		 851 aa  231  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  35.6 
 
 		 830 aa  228  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  33.28 
 
 		 834 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  34.2 
 
 		 836 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  32.86 
 
 		 826 aa  223  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  34.31 
 
 		 843 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  34.19 
 
 		 836 aa  220  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  32.13 
 
 		 851 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  36.78 
 
 		 476 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  36.2 
 
 		 366 aa  138  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  33.13 
 
 		 638 aa  118  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  34.87 
 
 		 498 aa  109  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3639  LigA  33.61 
 
 		 948 aa  57  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3697  LigA  33.33 
 
 		 951 aa  54.3  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0503311  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3780  LigA  31.97 
 
 		 948 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155782  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  37.5 
 
 		 845 aa  48.9  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  25 
 
 		 727 aa  46.2  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>