52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1727 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  72.65 
 
 
1209 aa  1739    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  100 
 
 
1224 aa  2441    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  96.24 
 
 
1224 aa  2305    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  96.24 
 
 
1224 aa  2303    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  72.56 
 
 
1209 aa  1734    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  84.84 
 
 
1237 aa  2084    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  32.65 
 
 
821 aa  343  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  33.41 
 
 
819 aa  330  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  32.15 
 
 
817 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  32.15 
 
 
835 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  32 
 
 
818 aa  303  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  31.82 
 
 
838 aa  300  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  31.97 
 
 
807 aa  291  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  30.86 
 
 
851 aa  291  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  30.86 
 
 
820 aa  291  6e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  32.21 
 
 
837 aa  275  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  30.33 
 
 
878 aa  269  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  30.67 
 
 
676 aa  266  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  31.5 
 
 
638 aa  238  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  27.32 
 
 
834 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  27.4 
 
 
836 aa  189  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  26.14 
 
 
826 aa  188  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  27.29 
 
 
811 aa  187  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  27.08 
 
 
836 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  25.64 
 
 
837 aa  178  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  29.64 
 
 
851 aa  177  7e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  26.35 
 
 
830 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  28.78 
 
 
843 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  28.78 
 
 
826 aa  174  9e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  26.2 
 
 
829 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  26.69 
 
 
851 aa  169  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  24.72 
 
 
840 aa  168  6.9999999999999995e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  26.74 
 
 
829 aa  165  5.0000000000000005e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  29.11 
 
 
829 aa  165  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  27.74 
 
 
651 aa  157  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  29.94 
 
 
476 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  33.98 
 
 
845 aa  104  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  28.07 
 
 
366 aa  92.4  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  29 
 
 
638 aa  90.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3639  LigA  30.43 
 
 
948 aa  60.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3697  LigA  30.36 
 
 
951 aa  59.7  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0503311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  26.71 
 
 
1746 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  33.77 
 
 
727 aa  54.7  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3780  LigA  31.87 
 
 
948 aa  54.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  32.84 
 
 
498 aa  54.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  28.81 
 
 
2795 aa  53.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  29.19 
 
 
1976 aa  51.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  25.87 
 
 
2358 aa  48.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  25.64 
 
 
2296 aa  47  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  30.08 
 
 
1084 aa  46.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  25.46 
 
 
2367 aa  45.8  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  25.46 
 
 
2383 aa  45.4  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>