52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1949 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  69.98 
 
 		 1209 aa  1671    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  69.82 
 
 		 1209 aa  1672    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  100 
 
 		 1237 aa  2454    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  84.84 
 
 		 1224 aa  2040    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  85.32 
 
 		 1224 aa  2068    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  85.4 
 
 		 1224 aa  2067    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  33.41 
 
 		 821 aa  351  5e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  33.93 
 
 		 819 aa  325  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  32.51 
 
 		 818 aa  311  5e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  32.03 
 
 		 838 aa  306  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  32.66 
 
 		 835 aa  304  6.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  31.94 
 
 		 817 aa  303  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  32.52 
 
 		 807 aa  298  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  31.31 
 
 		 820 aa  286  2.0000000000000002e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  31.43 
 
 		 851 aa  281  4e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  31.34 
 
 		 837 aa  278  5e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  31.65 
 
 		 676 aa  266  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  31.33 
 
 		 878 aa  266  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  31.81 
 
 		 638 aa  231  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  27.9 
 
 		 834 aa  211  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  27.76 
 
 		 836 aa  209  3e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  27.66 
 
 		 826 aa  207  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  26.01 
 
 		 837 aa  196  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  28.18 
 
 		 851 aa  195  5e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  28.09 
 
 		 811 aa  194  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  26.38 
 
 		 826 aa  194  9e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  27.48 
 
 		 830 aa  194  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  27.84 
 
 		 836 aa  193  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  28.53 
 
 		 851 aa  192  5e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  29.42 
 
 		 829 aa  188  6e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  28.37 
 
 		 829 aa  187  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  28.4 
 
 		 829 aa  184  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  25.52 
 
 		 840 aa  180  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  29.47 
 
 		 843 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  27.55 
 
 		 651 aa  160  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  32.39 
 
 		 845 aa  112  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  30.81 
 
 		 476 aa  110  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  28.65 
 
 		 638 aa  87.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  28.35 
 
 		 366 aa  83.2  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  30.59 
 
 		 498 aa  59.3  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  29.26 
 
 		 1084 aa  57.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  26.4 
 
 		 2795 aa  57.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  28.9 
 
 		 1976 aa  55.1  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  32.43 
 
 		 727 aa  53.1  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3639  LigA  23.58 
 
 		 948 aa  51.6  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3697  LigA  27.88 
 
 		 951 aa  50.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0503311  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3780  LigA  28.04 
 
 		 948 aa  48.5  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155782  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  25.17 
 
 		 2367 aa  47.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  25.17 
 
 		 2383 aa  47.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  24.71 
 
 		 2358 aa  46.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  24.94 
 
 		 2296 aa  46.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  24.94 
 
 		 2358 aa  45.4  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>