40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3742 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  54.17 
 
 
829 aa  822    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  100 
 
 
851 aa  1719    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  56.23 
 
 
834 aa  868    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  53.77 
 
 
829 aa  822    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  56.43 
 
 
837 aa  890    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  51.86 
 
 
826 aa  790    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  67.83 
 
 
843 aa  1057    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  54.52 
 
 
829 aa  820    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  55.76 
 
 
836 aa  854    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  53.49 
 
 
830 aa  790    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  55.45 
 
 
840 aa  872    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  55.3 
 
 
836 aa  850    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  53.54 
 
 
826 aa  827    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  60.14 
 
 
851 aa  941    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  38.04 
 
 
811 aa  502  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  30.46 
 
 
817 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  34.25 
 
 
819 aa  243  1e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  33.1 
 
 
821 aa  239  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  32.89 
 
 
676 aa  239  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  32.46 
 
 
807 aa  238  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  33.61 
 
 
818 aa  233  9e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  34.72 
 
 
638 aa  225  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  34.53 
 
 
820 aa  221  6e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  32.48 
 
 
851 aa  218  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  28.18 
 
 
1237 aa  211  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  27.91 
 
 
1209 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  27.91 
 
 
1209 aa  207  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  31.12 
 
 
838 aa  207  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  31.59 
 
 
878 aa  206  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  28.82 
 
 
835 aa  205  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  34.31 
 
 
651 aa  185  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  26.95 
 
 
1224 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  26.95 
 
 
1224 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  31.01 
 
 
837 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  26.79 
 
 
1224 aa  178  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  32 
 
 
476 aa  165  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  36.65 
 
 
366 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  33.22 
 
 
638 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  31.98 
 
 
498 aa  77  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  27.42 
 
 
614 aa  45.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>