44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1801 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  49.88 
 
 
817 aa  697    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  100 
 
 
837 aa  1662    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  68.18 
 
 
818 aa  1052    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  53.29 
 
 
807 aa  786    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  81.96 
 
 
838 aa  1301    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  51.5 
 
 
851 aa  755    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  50.46 
 
 
819 aa  692    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  68.18 
 
 
835 aa  1035    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  59.98 
 
 
821 aa  923    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  73.81 
 
 
820 aa  1129    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  48.08 
 
 
676 aa  592  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  39.93 
 
 
878 aa  494  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  31.83 
 
 
1237 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  32.59 
 
 
1209 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  32.59 
 
 
1209 aa  303  9e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  31.94 
 
 
1224 aa  299  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  31.94 
 
 
1224 aa  297  5e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  31.53 
 
 
1224 aa  289  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  30.88 
 
 
811 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  33.73 
 
 
638 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  29.65 
 
 
840 aa  238  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  30.55 
 
 
837 aa  237  7e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  30.2 
 
 
826 aa  223  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  29.58 
 
 
829 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  31.72 
 
 
843 aa  220  8.999999999999998e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  29.43 
 
 
829 aa  219  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  30.7 
 
 
826 aa  220  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  29.59 
 
 
829 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  30.59 
 
 
836 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  31.27 
 
 
834 aa  209  2e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  32.44 
 
 
651 aa  207  8e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  32.66 
 
 
836 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  29.46 
 
 
830 aa  205  3e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  30.17 
 
 
851 aa  200  7e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  29.27 
 
 
851 aa  195  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  33.56 
 
 
476 aa  156  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  30.67 
 
 
638 aa  102  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  40.86 
 
 
366 aa  99.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  33.66 
 
 
498 aa  90.9  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  29.78 
 
 
845 aa  85.5  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  26.27 
 
 
2795 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  33.33 
 
 
727 aa  54.3  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  27.62 
 
 
4672 aa  47  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1597  putative alpha-galactosidase precursor  26.63 
 
 
718 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.327767  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>