44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1853 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  51.87 
 
 		 835 aa  687    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  100 
 
 		 817 aa  1620    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  49.83 
 
 		 837 aa  658    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  52.72 
 
 		 821 aa  731    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  51.06 
 
 		 818 aa  685    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  63.18 
 
 		 807 aa  970    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  70.8 
 
 		 819 aa  1102    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  49.54 
 
 		 838 aa  660    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  49.17 
 
 		 820 aa  664    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  47.6 
 
 		 851 aa  634  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  51.67 
 
 		 676 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  38.8 
 
 		 878 aa  462  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  33.17 
 
 		 811 aa  307  6e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  32.8 
 
 		 1224 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  32.8 
 
 		 1224 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  31.94 
 
 		 1237 aa  303  8.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  32.15 
 
 		 1224 aa  297  6e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  32.99 
 
 		 1209 aa  290  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  38.36 
 
 		 638 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  32.88 
 
 		 1209 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  30.8 
 
 		 837 aa  250  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  33.85 
 
 		 826 aa  249  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  33.55 
 
 		 829 aa  249  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  31.61 
 
 		 840 aa  244  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  33.46 
 
 		 829 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  33.42 
 
 		 829 aa  242  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  32.9 
 
 		 826 aa  241  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  33.6 
 
 		 651 aa  239  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  29.34 
 
 		 851 aa  238  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  30.8 
 
 		 851 aa  230  7e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  31.85 
 
 		 836 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  32.59 
 
 		 843 aa  229  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  31.57 
 
 		 836 aa  228  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  30.79 
 
 		 834 aa  227  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  34.84 
 
 		 830 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  38.89 
 
 		 476 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  33.09 
 
 		 638 aa  150  9e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  33.88 
 
 		 366 aa  118  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  34.55 
 
 		 498 aa  92.4  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  26.5 
 
 		 845 aa  54.7  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  32.59 
 
 		 727 aa  51.6  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3697  LigA  30.93 
 
 		 951 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0503311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3639  LigA  31.58 
 
 		 948 aa  50.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3780  LigA  30.53 
 
 		 948 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>