41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3723 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  51.29 
 
 		 851 aa  776    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  52.39 
 
 		 836 aa  804    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  54.63 
 
 		 840 aa  853    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  56.62 
 
 		 837 aa  916    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  55.2 
 
 		 834 aa  845    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  54.18 
 
 		 829 aa  837    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  54.25 
 
 		 851 aa  822    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 826 aa  1644    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  54.06 
 
 		 829 aa  830    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  54.18 
 
 		 829 aa  835    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  49.94 
 
 		 843 aa  759    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  58.1 
 
 		 830 aa  910    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  53.04 
 
 		 836 aa  812    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  57.32 
 
 		 826 aa  885    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  35.84 
 
 		 811 aa  450  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  32 
 
 		 821 aa  266  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  33.87 
 
 		 807 aa  259  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  34.21 
 
 		 819 aa  251  6e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  33.85 
 
 		 817 aa  250  9e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  32.05 
 
 		 638 aa  234  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  32.22 
 
 		 820 aa  232  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  31.36 
 
 		 835 aa  225  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  32.86 
 
 		 676 aa  224  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  31.71 
 
 		 851 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  31.17 
 
 		 838 aa  220  7.999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  28.46 
 
 		 1209 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  28.46 
 
 		 1209 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  31.25 
 
 		 818 aa  211  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  30.2 
 
 		 837 aa  202  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  31.93 
 
 		 878 aa  200  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  26.38 
 
 		 1237 aa  194  7e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  29.73 
 
 		 651 aa  178  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  32.05 
 
 		 476 aa  169  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  25.91 
 
 		 1224 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  25.91 
 
 		 1224 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  28.78 
 
 		 1224 aa  165  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  33.75 
 
 		 366 aa  145  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  41.02 
 
 		 638 aa  111  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  33.01 
 
 		 498 aa  65.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3697  LigA  26.21 
 
 		 951 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0503311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3639  LigA  25.24 
 
 		 948 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>