44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2498 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  51.87 
 
 
817 aa  719    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  68.26 
 
 
837 aa  1029    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  68.66 
 
 
818 aa  1064    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  53.62 
 
 
676 aa  675    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  51.61 
 
 
807 aa  743    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  68.81 
 
 
838 aa  1061    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  57.08 
 
 
851 aa  820    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  51.29 
 
 
819 aa  703    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  100 
 
 
835 aa  1652    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  70.41 
 
 
820 aa  1095    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  61.3 
 
 
821 aa  940    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  41.28 
 
 
878 aa  517  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  34.46 
 
 
1209 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  34.35 
 
 
1209 aa  337  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  32.77 
 
 
1237 aa  332  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  32.66 
 
 
1224 aa  328  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  32.66 
 
 
1224 aa  326  9e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  32.36 
 
 
1224 aa  321  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  31.22 
 
 
811 aa  280  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  31.6 
 
 
826 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  33.53 
 
 
638 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  31.08 
 
 
851 aa  239  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  32.71 
 
 
826 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  31.51 
 
 
840 aa  234  5e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  30.75 
 
 
843 aa  234  6e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  30.72 
 
 
837 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  32.95 
 
 
829 aa  227  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  32.57 
 
 
829 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  32.2 
 
 
829 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  28.26 
 
 
851 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  31.2 
 
 
834 aa  220  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  29.87 
 
 
836 aa  217  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  30.96 
 
 
836 aa  217  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  28.46 
 
 
830 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  31.8 
 
 
651 aa  208  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  36.51 
 
 
476 aa  150  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  31.16 
 
 
638 aa  112  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  31.25 
 
 
366 aa  107  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  30.4 
 
 
845 aa  96.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  33.33 
 
 
498 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  35.14 
 
 
727 aa  64.7  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  26.13 
 
 
2795 aa  47  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4277  Ig domain-containing protein  34.15 
 
 
690 aa  47  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.191701 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  30.92 
 
 
2296 aa  46.2  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>