44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1195 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  100 
 
 		 878 aa  1755    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  41.46 
 
 		 821 aa  524  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  40.31 
 
 		 818 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  39.6 
 
 		 807 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  41.41 
 
 		 835 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  40.39 
 
 		 851 aa  487  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  40.61 
 
 		 819 aa  488  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  38.62 
 
 		 820 aa  480  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  40 
 
 		 838 aa  476  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  38.95 
 
 		 817 aa  466  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  39.67 
 
 		 837 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  40.77 
 
 		 676 aa  430  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  31.33 
 
 		 1237 aa  275  3e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  30.98 
 
 		 811 aa  272  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  30.14 
 
 		 1224 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  31.03 
 
 		 1209 aa  269  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  29.1 
 
 		 1224 aa  266  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  30.9 
 
 		 1209 aa  265  3e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  29.1 
 
 		 1224 aa  265  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  35.96 
 
 		 638 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  30.65 
 
 		 837 aa  226  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  30.63 
 
 		 826 aa  220  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  31.12 
 
 		 840 aa  219  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  31.04 
 
 		 836 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  30.23 
 
 		 829 aa  212  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  31.33 
 
 		 829 aa  212  3e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  31.57 
 
 		 829 aa  211  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  30.85 
 
 		 834 aa  207  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  31.93 
 
 		 826 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  29.81 
 
 		 836 aa  201  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  32.72 
 
 		 830 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  30.86 
 
 		 851 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  32.94 
 
 		 843 aa  194  8e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  29.8 
 
 		 851 aa  190  9e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  30.38 
 
 		 651 aa  190  9e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  29.74 
 
 		 476 aa  125  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  27.18 
 
 		 366 aa  94.4  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  32.49 
 
 		 638 aa  88.2  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  33.63 
 
 		 498 aa  88.2  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  27.25 
 
 		 845 aa  75.1  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  33.7 
 
 		 934 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  33.33 
 
 		 727 aa  52  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  27.86 
 
 		 2795 aa  48.1  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  27.5 
 
 		 1976 aa  45.4  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>