39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_0531 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  72.33 
 
 
829 aa  1160    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  56.5 
 
 
851 aa  848    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  61.59 
 
 
851 aa  963    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  84.95 
 
 
836 aa  1397    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  69.15 
 
 
840 aa  1083    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  79.78 
 
 
837 aa  1286    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  100 
 
 
834 aa  1671    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  55.2 
 
 
826 aa  863    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  59.03 
 
 
843 aa  863    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  71.87 
 
 
829 aa  1161    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  86.86 
 
 
836 aa  1437    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  77.66 
 
 
826 aa  1289    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  56.13 
 
 
830 aa  860    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  71.63 
 
 
829 aa  1151    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  38.59 
 
 
811 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  36.79 
 
 
821 aa  260  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  32.09 
 
 
819 aa  244  6e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  34.92 
 
 
807 aa  231  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  30.79 
 
 
817 aa  228  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  33.28 
 
 
676 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  32.66 
 
 
820 aa  225  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  32.33 
 
 
818 aa  219  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  27.93 
 
 
1209 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  27.93 
 
 
1209 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  33.16 
 
 
851 aa  213  2e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  31.24 
 
 
838 aa  212  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  27.75 
 
 
1237 aa  211  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  30.55 
 
 
878 aa  207  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  34.15 
 
 
638 aa  205  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  31.2 
 
 
835 aa  195  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  31.99 
 
 
837 aa  189  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  26.27 
 
 
1224 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  26.27 
 
 
1224 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  27.15 
 
 
1224 aa  185  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  32.82 
 
 
476 aa  177  9e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  30.47 
 
 
651 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  32.5 
 
 
366 aa  137  6.0000000000000005e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  36.57 
 
 
638 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  32.79 
 
 
498 aa  62.4  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>