46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2330 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  68.66 
 
 		 835 aa  1052    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  50.83 
 
 		 819 aa  696    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  50.47 
 
 		 817 aa  707    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  68.18 
 
 		 837 aa  1037    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  100 
 
 		 818 aa  1622    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  55.36 
 
 		 676 aa  696    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  61.26 
 
 		 821 aa  952    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  54.5 
 
 		 851 aa  781    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  49.64 
 
 		 807 aa  729    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  67.66 
 
 		 838 aa  1037    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  71.13 
 
 		 820 aa  1087    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  40.58 
 
 		 878 aa  513  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  32.91 
 
 		 1237 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  32.91 
 
 		 1209 aa  320  7e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  33.02 
 
 		 1209 aa  319  1e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  31.83 
 
 		 1224 aa  313  9e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  31.83 
 
 		 1224 aa  312  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  31.6 
 
 		 1224 aa  311  4e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  31.66 
 
 		 811 aa  290  7e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  35.43 
 
 		 638 aa  267  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  32.37 
 
 		 837 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  33.24 
 
 		 840 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  33.53 
 
 		 651 aa  239  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  32.65 
 
 		 826 aa  229  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  32.19 
 
 		 834 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  33.11 
 
 		 843 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  31.71 
 
 		 851 aa  226  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  34.4 
 
 		 851 aa  226  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  32.45 
 
 		 836 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  32.61 
 
 		 836 aa  223  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  33.16 
 
 		 829 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  30.8 
 
 		 826 aa  221  5e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  32.59 
 
 		 829 aa  220  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  32.75 
 
 		 829 aa  219  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  29.61 
 
 		 830 aa  204  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  34.97 
 
 		 476 aa  163  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  33.85 
 
 		 366 aa  115  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  32.89 
 
 		 638 aa  109  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  29.01 
 
 		 845 aa  87.8  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  30.88 
 
 		 498 aa  74.3  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  27.8 
 
 		 1976 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  26.4 
 
 		 2795 aa  52  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3697  LigA  31.13 
 
 		 951 aa  51.2  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0503311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3639  LigA  30.56 
 
 		 948 aa  50.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20708  predicted protein  23.47 
 
 		 475 aa  45.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558415  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3780  LigA  29.63 
 
 		 948 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>