41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0493 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 829 aa  1664    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  69.64 
 
 		 837 aa  1131    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  77.8 
 
 		 836 aa  1285    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  71.63 
 
 		 834 aa  1150    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  95.54 
 
 		 829 aa  1593    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  59.44 
 
 		 851 aa  867    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  54.83 
 
 		 826 aa  826    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  74.58 
 
 		 840 aa  1214    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  96.14 
 
 		 829 aa  1603    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  53.88 
 
 		 843 aa  757    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  54.83 
 
 		 830 aa  837    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  77.33 
 
 		 836 aa  1269    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  80.77 
 
 		 826 aa  1332    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  54.17 
 
 		 851 aa  797    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  40.2 
 
 		 811 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  33.65 
 
 		 821 aa  256  9e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  34.62 
 
 		 817 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  39.7 
 
 		 807 aa  242  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  34.56 
 
 		 676 aa  241  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  38.03 
 
 		 819 aa  236  9e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  33.38 
 
 		 638 aa  231  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  35.73 
 
 		 851 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  32.82 
 
 		 820 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  32.84 
 
 		 838 aa  213  9e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  30.88 
 
 		 878 aa  211  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  32.35 
 
 		 818 aa  210  8e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  31.15 
 
 		 837 aa  204  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  27.31 
 
 		 1209 aa  201  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  27.31 
 
 		 1209 aa  201  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  33.73 
 
 		 835 aa  195  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  29.42 
 
 		 1237 aa  188  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  31.43 
 
 		 651 aa  188  4e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  33.58 
 
 		 476 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  26.32 
 
 		 1224 aa  161  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  27 
 
 		 1224 aa  160  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  27 
 
 		 1224 aa  160  8e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  32.46 
 
 		 366 aa  122  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  30.71 
 
 		 638 aa  117  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  33.33 
 
 		 498 aa  62.8  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3697  LigA  22.96 
 
 		 951 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0503311  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3639  LigA  21.21 
 
 		 948 aa  44.3  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>