47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2843 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1533  Ig domain-containing protein  53.11 
 
 		 807 aa  798    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2226  Ig domain-containing protein  49.77 
 
 		 819 aa  691    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736647 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2498  Ig domain-containing protein  68.81 
 
 		 835 aa  1059    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.284109  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2252  Ig domain-containing protein  53.33 
 
 		 851 aa  790    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.124017  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1320  Ig-like, group 1  59.5 
 
 		 821 aa  913    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00729266  normal  0.247272 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2480  Ig domain-containing protein  74.37 
 
 		 820 aa  1147    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.311981  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2843  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 838 aa  1667    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000356214  decreased coverage  0.00000000529133 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1853  Ig domain protein group 1 domain protein  49.54 
 
 		 817 aa  699    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.498276  hitchhiker  0.000000271075 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2330  Ig-like, group 1  67.54 
 
 		 818 aa  1046    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1801  Ig domain-containing protein  81.96 
 
 		 837 aa  1291    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716764  hitchhiker  0.0000241302 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4101  Ig domain-containing protein  48.94 
 
 		 676 aa  610  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1195  intimin/invasin family protein  39.95 
 
 		 878 aa  495  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.634  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  31.77 
 
 		 1237 aa  320  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  31.26 
 
 		 1224 aa  313  1e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  31.26 
 
 		 1224 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  32.04 
 
 		 1209 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  32.15 
 
 		 1209 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  31.01 
 
 		 1224 aa  302  1e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  31.75 
 
 		 811 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2663  Ig-like, group 1  33.59 
 
 		 638 aa  259  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000158035 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3807  Ig domain-containing protein  31.6 
 
 		 837 aa  257  8e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0592  Ig domain-containing protein  32.3 
 
 		 840 aa  241  5.999999999999999e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4080  hypothetical protein  30.25 
 
 		 826 aa  236  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3723  Ig domain-containing protein  31.17 
 
 		 826 aa  233  9e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00549605  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4390  Ig domain-containing protein  30.6 
 
 		 843 aa  230  9e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0570  Ig domain-containing protein  30.67 
 
 		 851 aa  229  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.131384 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0493  Ig domain-containing protein  32.35 
 
 		 829 aa  225  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0531  Ig domain-containing protein  32.07 
 
 		 834 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.33736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3457  Ig domain-containing protein  32.46 
 
 		 829 aa  220  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0510  Ig domain-containing protein  32.73 
 
 		 836 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3633  Ig domain-containing protein  31.99 
 
 		 829 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0536  Ig domain protein group 1 domain protein  30.4 
 
 		 836 aa  218  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3742  Ig domain-containing protein  28.84 
 
 		 851 aa  210  9e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3069  hypothetical protein  29.74 
 
 		 830 aa  207  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0314  hypothetical protein  31.5 
 
 		 651 aa  206  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.358502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0783  hypothetical protein  33.18 
 
 		 476 aa  157  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.628796  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0677  hypothetical protein  27.15 
 
 		 638 aa  99.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2695  carbamoyl-phosphate synthase, large subunit, glutamine-dependent  30.81 
 
 		 366 aa  97.8  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000319474  decreased coverage  0.000345849 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  29.12 
 
 		 845 aa  86.3  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0935  hypothetical protein  34.76 
 
 		 498 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  27.72 
 
 		 2367 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  27.72 
 
 		 2358 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  27.72 
 
 		 2383 aa  50.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  27.46 
 
 		 2296 aa  48.5  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  31.76 
 
 		 727 aa  48.1  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  27.39 
 
 		 2620 aa  47.8  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  27.13 
 
 		 2795 aa  46.2  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>