84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_01881 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012892  B21_01881  hypothetical protein  100 
 
 
2367 aa  4808    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0890809  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01891  adhesin  100 
 
 
2383 aa  4808    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0926069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1674  Ig domain protein group 1 domain protein  99.87 
 
 
2358 aa  4786    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2821  hypothetical protein  72.17 
 
 
2620 aa  2520    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0867101  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2261  putative invasin  97.55 
 
 
2296 aa  4478    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000213417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4876  putative invasin  49.07 
 
 
1746 aa  1346    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.847065  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4024  putative invasin  41.05 
 
 
2933 aa  1296    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.43506  normal  0.407201 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1146  putative invasin  97.16 
 
 
2358 aa  4607    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0236559  hitchhiker  0.00000000373637 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3322  Ig domain-containing protein  32.26 
 
 
1418 aa  560  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0351  putative invasin  32.6 
 
 
1417 aa  559  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0312  EaeH  32.79 
 
 
1396 aa  554  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0331  putative invasin  33.76 
 
 
1417 aa  547  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  29.89 
 
 
2795 aa  549  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  30.41 
 
 
1976 aa  527  1e-147  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0351  putative intimin  44.95 
 
 
1417 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.751888  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0145  hypothetical protein  41.4 
 
 
5337 aa  446  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4008  putative invasin  42.26 
 
 
4953 aa  438  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4116  hypothetical protein  42.18 
 
 
2933 aa  431  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.863096 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1705  Ig-like domain-containing protein  34.47 
 
 
1050 aa  401  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.012785  hitchhiker  0.00366104 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2513  Ig domain-containing protein  34.35 
 
 
1075 aa  398  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2416  putative intimin  34.47 
 
 
1075 aa  399  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3359  Ig family protein  43.89 
 
 
1084 aa  372  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2429  invasin region 3  40.32 
 
 
969 aa  323  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.621215  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2329  invasin  40.32 
 
 
941 aa  322  5e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.942783  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00256  attaching and effacing protein, pathogenesis factor  53.91 
 
 
410 aa  321  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5054  intimin C-type lectin domain protein  39.9 
 
 
934 aa  296  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3306  hypothetical protein  54.35 
 
 
295 aa  289  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0152605  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00260  hypothetical protein  54.35 
 
 
292 aa  288  5.999999999999999e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2754  Aec1  38.22 
 
 
730 aa  271  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0468498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2885  hypothetical protein  36.18 
 
 
730 aa  264  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2774  hypothetical protein  36.18 
 
 
730 aa  264  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.244866  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2668  Aec1  36.18 
 
 
730 aa  263  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2661  putative adhesin  34.89 
 
 
724 aa  255  6e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.440388 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2711  hypothetical protein  35.96 
 
 
730 aa  254  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2319  hypothetical protein  31.89 
 
 
468 aa  190  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2901  hypothetical protein  30.9 
 
 
497 aa  184  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1905  hypothetical protein  29.98 
 
 
474 aa  170  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1899  hypothetical protein  29.98 
 
 
509 aa  170  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.381916 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1372  hypothetical protein  29.98 
 
 
474 aa  169  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.567919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1963  hypothetical protein  29.98 
 
 
474 aa  169  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.321067 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1370  hypothetical protein  32.41 
 
 
464 aa  167  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.305056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1329  hypothetical protein  32.41 
 
 
464 aa  166  3e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.953339  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1555  hypothetical protein  29.73 
 
 
474 aa  166  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.125708 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2403  hypothetical protein  32.41 
 
 
476 aa  166  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000223756 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1703  hypothetical protein  32.41 
 
 
476 aa  166  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.401694  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2426  putative invasin  32.41 
 
 
464 aa  166  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0439788  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01208  hypothetical protein  32.41 
 
 
417 aa  164  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01198  predicted invasin  32.41 
 
 
417 aa  164  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1920  hypothetical protein  32.41 
 
 
464 aa  164  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.10975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1387  hypothetical protein  32.13 
 
 
464 aa  162  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1482  hypothetical protein  36.63 
 
 
660 aa  158  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.498309  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1663  hypothetical protein  36.63 
 
 
660 aa  157  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0949779 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1794  hypothetical protein  35.79 
 
 
660 aa  156  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.804919  normal  0.140195 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1854  hypothetical protein  35.79 
 
 
660 aa  156  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1792  hypothetical protein  36.26 
 
 
660 aa  155  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.66641  normal  0.146371 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1994  invasin domain-containing protein  29.69 
 
 
690 aa  140  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a028  putative adhesin/invasin  32.8 
 
 
1459 aa  115  7.000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02885  hypothetical protein  33 
 
 
543 aa  94.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2782  Ig domain protein group 1 domain protein  24.22 
 
 
4672 aa  74.7  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117201 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02355  invasin domain protein  26.34 
 
 
845 aa  72.8  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.497303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0529  Ig domain-containing protein  25.24 
 
 
3209 aa  70.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000000000708998 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0328  Ig domain-containing protein  27.81 
 
 
830 aa  64.7  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.979457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2358  Ig-like, group 1  26.29 
 
 
727 aa  62  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00702146  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0191  Ig-like, group 1  33.11 
 
 
811 aa  59.3  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000536098  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1001  Ig domain-containing protein  26.42 
 
 
614 aa  57.4  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.313709  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  32.92 
 
 
1005 aa  56.2  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1583  Ig domain-containing protein  26.16 
 
 
1224 aa  55.8  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.61768  normal  0.0651551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0821  Ig domain-containing protein  29.38 
 
 
609 aa  55.8  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0946552  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1658  Ig domain-containing protein  26.16 
 
 
1224 aa  55.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.377498  hitchhiker  0.000563606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2611  Ig domain-containing protein  26.35 
 
 
1209 aa  54.7  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062709 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1179  adhesin-like protein  37.37 
 
 
372 aa  54.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00551453  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05976  hypothetical protein  29.52 
 
 
850 aa  54.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05990  hypothetical protein  29.55 
 
 
857 aa  54.3  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0559  hypothetical protein  32.71 
 
 
302 aa  53.5  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0270722  normal  0.124487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2415  hypothetical protein  28.4 
 
 
507 aa  53.5  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0103348 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2924  Ig-like, group 1  37.39 
 
 
633 aa  53.1  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2491  Ig domain-containing protein  25.18 
 
 
1209 aa  51.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1937  Ig domain-containing protein  27.21 
 
 
528 aa  51.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000246116  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07115  hypothetical protein  24.5 
 
 
1164 aa  50.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0553  von Willebrand factor, type A  29.09 
 
 
1002 aa  49.7  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.253544  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5514  hypothetical protein  27.54 
 
 
1504 aa  48.5  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4857  hypothetical protein  25.74 
 
 
1112 aa  48.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1949  invasin domain-containing protein  25.17 
 
 
1237 aa  47  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1727  Ig domain-containing protein  25.46 
 
 
1224 aa  46.2  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.106608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>